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Vibrio fischeri regulatory protein LuxR (luxR) gene
LuxC and LuxD both with ribosome binding site B0032.
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Vibrio fischeri regulatory protein LuxR (luxR) gene
LuxA and LuxB both with the ribosome binding site B0032. Together LuxA and LuxB can produce bioluminescence if decanal is present, which in the original lux operon is provided from the complex formed by LuxCDE.
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LuxG with ribosome binding site B0032
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The Plac insert was PCR'd from the MG1655 strain of E.coli K12.
Released HQ 2013
Inverting regulatory region controlled by LacI (<bb_part>BBa_C0010</bb_part>, <bb_part>BBa_C0011</bb_part>, etc.) <p> The pLac regulatory region is a 243 base-pair sequence with standard BioBrick prefix and suffix sections on its ends. It contains two protein binding sites: CAP, which is generally present in E.coli and is assocciated with cell health and availability of glucose., and LacI, the Lac inhibitor <bb_part>BBa_C0010</bb_part> which binds in an dimerized cooperative manner to inhibit the transcription of the protein that follows. In the presence of lactose or IPTG, an analog of lactose, LacI is unable to correctly bind and inhibit transcription. This allows <bb_part>BBa_R0010</bb_part> to be used as a inverter or as a detector of lactose or IPTG.
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<P> <P><P> LacI binds to this regulator. This part is incompatible with species containing active LacI coding regions. Lactose and IPTG disable the operation of LacI and this regulator. This part is incompatible with environments containing lactose or lactose analogs.
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BBa_K1725217
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BBa_K1725217
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Vibrio fischeri regulatory protein LuxR (luxR) gene
LuxC, LuxD and LuxE with the ribosome binding site B0032.
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BBa_B0032
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BBa_B0032
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Released HQ 2013
Weak1 RBS based on Ron Weiss thesis. Strength is considered relative to <bb_part>BBa_B0030</bb_part>, <bb_part>BBa_B0031</bb_part>, <bb_part>BBa_B0033</bb_part>.
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Varies from -6 to +1 region from original sequence to accomodate BioBricks suffix ("RBS-2" in figure 4-14 of thesis). <P>
Contact info for this part: <a href="mailto:(bchow@media.mit.edu)">Brian Chow</a>
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Vinay S Mahajan, Voichita D. Marinescu, Brian Chow, Alexander D Wissner-Gross and Peter Carr IAP, 2003.
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BBa_K1725216
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BBa_K1725216
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Vibrio fischeri regulatory protein LuxR (luxR) gene
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tcacacaggaaagtactagatgaagtttggaaatatttgtttttcgtatcaaccaccaggtgaaactcataagcaagtaatggatcgctttgttcggcttggtatcgcctcagaagaggtagggtttgatacatattggaccttagaacatcattttacagagtttggtcttacgggaaatttatttgttgctgcggctaacctgttaggaagaactaaaacattaaatgttggcactatgggggttgttattccgacagcacacccagttcgacagttagaagacgttttattattagatcaaatgtcgaaaggtcgttttaattttggaaccgttcgagggctataccataaagattttcgagtatttggtgttgatatggaagagtctcgagcaattactcaaaatttctaccagatgataatggaaagcttacagacaggaaccattagctctgatagtgattacattcaatttcctaaggttgatgtatatcccaaagtgtactcaaaaaatgtaccaacctgtatgactgctgagtccgcaagtacgacagaatggctagcaatacaagggctaccaatggttcttagttggattattggtactaatgaaaaaaaagcacagatggaactctataatgaaattgcgacagaatatggtcatgatatatctaaaatagatcattgtatgacttatatttgttctgttgatgatgatgcacaaaaggcgcaagatgtttgtcgggagtttctgaaaaattggtatgactcatatgtaaatgcgaccaatatctttaatgatagcaatcaaactcgtggttatgattatcataaaggtcaatggcgtgattttgttttacaaggacatacaaacaccaatcgacgtgttgattatagcaatggtattaaccctgtaggcactcctgagcagtgtattgaaatcattcaacgtgatattgatgcaacgggtattacaaacattacatgcggatttgaagctaatggaactgaagatgaaataattgcttccatgcgacgctttatgacacaagtcgctcctttcttaaaagaacctaaataatactagagtcacacaggaaagtactagatgaaatttggattattttttctaaactttcagaaagatggaataacatctgaagaaacgttggataatatggtaaagactgtcacgttaattgattcaactaaatatcattttaatactgcctttgttaatgaacatcacttttcaaaaaatggtattgttggagcacctattaccgcagctggttttttattagggttaacaaataaattacatattggttcattaaatcaagtaattaccacccatcaccctgtacgtgtagcagaagaagccagtttattagatcaaatgtcagagggacgcttcattcttggttttagtgactgcgaaagtgatttcgaaatggaattttttagacgtcatatctcatcaaggcaacaacaatttgaagcatgctatgaaataattaatgacgcattaactacaggttattgtcatccccaaaacgacttttatgattttccaaaggtttcaattaatccacactgttacagtgagaatggacctaagcaatatgtatccgctacatcaaaagaagtcgtcatgtgggcagcgaaaaaggcactgcctttaacatttaagtgggaggataatttagaaaccaaagaacgctatgcaattctatataataaaacagcacaacaatatggtattgatatttcggatgttgatcatcaattaactgtaattgcgaacttaaatgctgatagaagtacggctcaagaagaagtgagagaatacttaaaagactatatcactgaaacttaccctcaaatggacagagatgaaaaaattaactgcattattgaagagaatgcagttgggtctcatgatgactattatgaatcgacaaaattagcagtggaaaaaacagggtctaaaaatattttattatcctttgaatcaatgtccgatattaaagatgtaaaagatattattgatatgttgaaccaaaaaatcgaaatgaatttaccataa
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igem2sbol
1
iGEM to SBOL conversion
Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1
Chris J. Myers
James Alastair McLaughlin
2017-03-06T15:00:00.000Z