BBa_K260000
1
BBa_K260000
pCC2FosM
2009-10-16T11:00:00Z
2015-05-08T01:11:42Z
EPICENTRE Biotechnologies (http://www.epibio.com/item.asp?ID=385)
human MECP2 genomic sequence.
This is a fosmid based on pCC2Fos from EPICENTRE Biotechnologies (http://www.epibio.com/item.asp?ID=385). It contains 38 kb from the human MECP2 genomic locus, with a spectinomycin resistance (SpecR) cassette in the first intron of MECP2.
This fosmid is used to accept by recombineering the HincII fragment from BBa_K260016 (inside backbone BBa_K260010). This reaction also transfers the blasticidin resistance gene (BsdR) to generate the new backbone BBa_K260001 (pCC2FosMB), then containing the same BBa_K260016 part.
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_356_
0
1072
57
It's complicated
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Intron 1 of MECP2 previously contained a BsdR cassette. This had to be changed to SpecR by recombineering to generate the present fosmid.
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Kaj Bernhardt
annotation2048640
1
End of human MECP2 genomic sequence
range2048640
1
39898
39898
annotation2048642
1
CmR
range2048642
1
40335
40994
annotation2055142
1
selection cassette
range2055142
1
35196
36374
annotation2048641
1
SpecR
range2048641
1
35631
36305
annotation2048620
1
Start of human MECP2 genomic sequence
range2048620
1
383
383
annotation2048619
1
T7 promoter
range2048619
1
311
329
BBa_K260000_sequence
1
gcggccgcaaggggttcgcgtcagcgggtgttggcgggtgtcggggctggcttaactatgcggcatcagagcagattgtactgagagtgcaccatatgcggtgtgaaataccgcacagatgcgtaaggagaaaataccgcatcaggcgccattcgccattcagctgcgcaactgttgggaagggcgatcggtgcgggcctcttcgctattacgccagctggcgaaagggggatgtgctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacgacggccagtgaattgtaatacgactcactatagggcgaattcgagctcggtacccggggatcccacgtacaacgacacctagaccacttctgtgccttcttttaagaaatgtctattaaggtcttttgctttttttctgagacagagtctcgctcttgtcacccaggctggagtgcagtgacgcgatcttggctcactacaacctcggcctcccgggttcaagcaattctcctgcctcagcctctgggaggcaggattacaggcgcctgggattacaggcacctgccaccacgccaggctaatatttgtatttttggtagagatggggtttcaccatgttggtcaagctgctctcgaaatcctgacctcagatgatcctcctgactcggcctcccaaagtcctgggattacaggcgtgaaccactgcgccaggccccattttgttttgttttgtttttgagacagaatcccattccatcacccaggctggagcacagtggtacacacatggcttactgcagcctcaaactcttgggcttgactgatcctcccacttcagcctcccaagtagctgggacttaacatgccatagttacagtgttatagcgttttgtgttttttatgtacttactattaccactgaattttataccttcaagtgatttcttattgctcattaacatccttttcttttagattgaactgctcccattagcatttcttgtaggacaggtttgggaccgatgaaatccatcagcttttgtttgtctggcaaagtctttatttctcttttgtgtttgaagaatatttttgccagttatactattctagggtaagctttttttccttcagcactttaaatatgtcatgccactctctcctggcctgtcaggtttccactgagaagtcagcggcctccattgcatgttatttgtttcttttctcttgctgcttttgggatcctttctttatccttaacctttgggatctaagtgtttggtcactgcagctgtatctgctttagggggcaccccaagccgagtaaccctgtggttcttgcaggtggcaaaggcagccaggccagtgtcgtcccctccagggtggcgagttccccccagtcctgggcggatacagagatgccatttgggagccagtgcctgtagttgggagtcttaggaatctagttggtgctgtattctactgtggctaagctggcacccaagctgcgagacacaggccttcccactcttgcctcccttttccacaggcagagaaccctcaccccacagccaccactgccccaggcccacggggagtactgccagactatcgctcgtgttcactcgaggaccaacggccctcagtcagcttgtggtgaatatgctgccatgcctgagcctctctcttcagggcagtgggatcccctctagccctagggcaggtcaggagcccaggcctggaactggaactggggaccccaggagcccacttggtgcactactccgctgtggtcgagctggtacccaagctgcgagacaaagtcccctttactcttccctcccttttcctcaaaccgaaggggtctctgcctgtggccaccgcagctgggagtgtgctgggcccgcacggctctgagtgtcagccgaggcctgcagcaagtacggcctgggtatggctgctggttcctcagtgcccaagagcccttcagtcagcaggtgatgagtcccgctagactgggtccttctcttcccttccggccgagggtgtctagaaatgtcgtctgggagctagggcctggaatgggggcctcacgactctgaccagtgccccatcttactgtggttgagctggtatccaagacacaagacaatgtcctccccacttttccgtgtcctctcctcaagcaagaggaaggaggggctcctggagctgtgagcggcactgcctggccttgggggaggggaggtgtaagcatggcccgagctaccccggctgctatctcactaagtcgcttgtaccccaagtccgctggctccgagcccagtccagcagcaggacttgcccgggacttgccgtccttgttgcctagactgcctttcaagtatatttcaggcccctgaatactttaggccgcagtggtgaggctttgctggagctcaggctccatccgctgaagatgggcgattcctctccggctagggctgatgtaaatcctcccttcgtgggcgcccgctaacttctgccccgtgttgctttctgctgggacacggcagcagcgctgagttccgacgcaaagccccacagtcaccgtgccctccctcccccaagtgtacagcttctctctctgcaccacgaggctgctgcggagcgggggctgggggtggggggtgccggggctgaggctggggcgcggggcggggagtgattcaagactgtccttcctacccttgtcacggcctctttcagtgatgtgaagttcaaccaggtcctgtgatcgctcacctgatttttggatattaggaaagtgcttttttgtgtggctagttgttcaatttggtgttcccgcagtggggatgatcactggaggcttctatttggccatgctgttctgcctctctctctatcttctgtgttgataaagccctttcaatattagtaagtgtatttaacacagtagagattcctgaagcttcttcatgactgttcaatttgggcctgatagcaatatgcgtttccttgtttcttatcctgtgactgagcaagcaggacattgtaacagtggaggaaaaatccccagttttccatgttctctcatccaaaaactttttgagagaaagagtacatttaggaagcaggacgaccatttagatttttactaatagcctggttttatatggttggttttatatggctatttataaatgttttgatttaacttgttaaagtgtaatatcccaaaattctatgatttatttttctcttttcccattgcaatatttatttatttatttatttattttgagacagagtctttctctgttgcccaggcttgggtgcactggtgcaatctcggctcactgcaacctccgcctcccgggttcaagcgattctcttgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggtgcaccccaccatgcccggataatttttgtatctttggtagagacccagttttgccatgttggccaggctagtctcaaactcccaacctcagatgatccacctgcctcagcttcccaaagtgctggggttacaggcatgaggcaccacaccccgccccattccagtatttaaaaacgacttttgtgcacagaaaagagataacatgatgatttgttccccacaacttcaacttatttaatttaattaaaatttctaaacaggttaccatgtatataggaaggaaaacccacattgtatagagaccaaaatttatataatttagggttcctctttaagaatactaaatcacttgcaaatgtgtccattcatttagaaaaagataagaaatcacaacaaattacaaattttaaaaagctgacaaatacaacaaaaggcagcaaagtacaatgtttttgttcctattatattttgtactgaagctacctgtgttatcttttttccccacattttggctgcatagtgttagatcgcatcttcatctgacaatgatattgtgacataattctcactagagggaacagaaagataaagcagtcttccttccactctgcttgactgaaatgttttctgattgctatcacacagtctttgtttgtttccttatcagtaaagctgcaccagaaacttcctctgtcatttcctgctcagaggcgctccctgccccaggactagctctctgggtgtggcctgtggtccgtggtgtggcctgtggtgtggcccatcagtccgcccaggggtcactcgccctctgtgtggccagttgctgggttgctgttcctgcagcagctgccctaccctggccaggcccttactgtccctggttctctccatcccaggaccatcctaataaccgtttctccttttttctttttctttttttttttttggagacggagtctctctctgttgcccaggttggagtgcagtggcatgatctcagctcactgcaagctccgcctcccaggttcaagcgattgtcttgcctcagcctcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgctcaccaccacgcccggctaatgtttgtatttttagtagagaagcagtttcaccatgttggccgggctggtctcgaactcccgacctcaagtgatccgcgcaccttggcctcccaaagtgctgggataacaggcgtgagccaccgcgcccggcccatcctaataaccttgaagcctgattgtagcctcccctctcccacctgtcctcaaccatgcagggagtggagcagtgcctcacagggttcctcctcctggaagtcaaagaaaagtcaagcttttgatgaggtctggcagcccccgtgctaccactgaccagggtgtgagggtggcccaggcctctagtgcccagctggggtagctgcccagtccccaactgtgtggagagattctcaccgtggggaaactctaactttgagagtttgtcttaaaaggccagcacttttatagtatcagaggtttggccctacattttaaa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igem2sbol
1
iGEM to SBOL conversion
Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1
Chris J. Myers
James Alastair McLaughlin
2017-03-06T15:00:00.000Z