BBa_K314204 1 BBa_K314204 p4T6S::T7 2010-10-21T11:00:00Z 2015-05-08T01:11:55Z Original source was from ''P. aeruginosa'' PA01 genome library--fosmid O24--from Mike Jacobs at University of Washington Department of Immunology. A fosmid (F' BAC) which encodes the HSI-I Type VI Secretion locus of ''Pseudomonas aeruginosa''. The locus has been engineered using homologous recombination to replace native promoters with robust T7 promoters. The two promoters are contained in the same intergenic region, with one on the positive strand and one on the negative. We are using this plasmid to express a Type VI Secretion System in the BL21(DE3) strain of ''E. coli'' which has an IPTG inducible T7 RNA polymerase. The purpose of the system is to create a probiotic system, creating a secretion system for a toxin/antitoxin system (BBa_K314200-BBa_K3142003). The system allows for protein delivery directly from the donor cell into the periplasm or cytosol of the recepient organism. While we are using this system to deliver a toxin, other protein effectors might be used for a range of applications. true false _496_ 0 6398 9 Discontinued false The size of the gene locus was too large to effectively BioBrick; there are several NotI and other restriction sites in crucial parts of necessary genes. false Laura Austin annotation2095337 1 pppA range2095337 1 16156 16884 annotation2095338 1 icmF1 range2095338 1 17571 20876 annotation2095343 1 RBS range2095343 1 25900 25905 annotation2095336 1 ppkA range2095336 1 13050 16148 annotation2095347 1 clpV1 range2095347 1 34011 36719 annotation2095342 1 T7 promoter range2095342 1 25876 25894 annotation2095339 1 fha1 range2095339 1 24313 25806 annotation2095348 1 VgrG1 range2095348 1 36766 38697 annotation2095340 1 RBS range2095340 1 25812 25817 annotation2095346 1 hcp1 range2095346 1 29141 29629 annotation2095341 1 T7 promoter range2095341 1 25825 25844 BBa_K314300 1 T6SS T6SS fosmid 2010-10-21T11:00:00Z 2015-05-08T01:11:55Z Pseudomonas aeruginosain Type six secretion system from Pseudomonas aeruginosain a pCC2Fos CopyControl Fosmid. false true _496_ 0 6501 9 It's complicated true space holder false Laura Austin annotation2109313 1 icmF1 range2109313 1 17568 20872 annotation2109320 1 RBS range2109320 1 25812 25817 annotation2109387 1 RBS range2109387 1 25900 25905 annotation2109317 1 VgrG1 range2109317 1 36764 38693 annotation2109315 1 hcp1 range2109315 1 29150 29628 annotation2109383 1 T7 promoter range2109383 1 25876 25894 annotation2109312 1 pppA range2109312 1 16153 16881 annotation2109335 1 T7 promoter range2109335 1 25825 25844 annotation2109316 1 clpV1 range2109316 1 34011 36719 annotation2109314 1 fha1 range2109314 1 24312 25806 annotation2109311 1 ppkA range2109311 1 13048 16146 BBa_K314300_sequence 1 gcggccgcaaggggttcgcgtcagcgggtgttggcgggtgtcggggctggcttaactatgcggcatcagagcagattgtactgagagtgcaccatatgcggtgtgaaataccgcacagatgcgtaaggagaaaataccgcatcaggcgccattcgccattcagctgcgcaactgttgggaagggcgatcggtgcgggcctcttcgctattacgccagctggcgaaagggggatgtgctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacgacggccagtgaattgtaatacgactcactatagggcgaattcgagctcggtacccggggatcccaccgaacgggcgaccacctcgccacgctcgtcgctcagtagcgccagcgccctgcgcaattgcgggcgcacctccaggcgatagcgccggcccgcctcgaagccgtcatagaccacctgctggtagcagttgatctgcaccggctcgccgaagccgccccccccgccgccggaaccgccatagagttcgtactggaagcgcacctccagcacatggcgtcccggagtgacctggaagtagcgcccgtcgctcaaccgctcgccgtccaggcgctcggccagcagggtgttggccggcgcgctgcgcagctcgacccaggccatctgcgggtccggctgcggcagcggtccggcgcagccggcgaggagcagcagcgcgagcgggacgagacgggtgagtggacgcatggggcgggctccggagggtgttcagctcctagcatagcgccctcgccttgcgccgttcagaccttcgcgcagcgcccctcgcggccgcgcgccagttccctgttgtcctggtcgtagagcttcgcccagggacggaagccgatgtgcccggcctccaggcggtagcgctggccggcgctgaagtccttgaacttgaggttgagctggcaatcgcgccagagcgggctgtccacggggccgatgttggtcgggtcgacggtgaactggtagcgcaccgtgagttcgcgggtgccgggatcgacctcgaagtagcgcgtgcggtcccagctcttgtcgtcgacttccacggcggcgagatcggcgtcgggctgggtatcgaggtcgacccaggcgcggttcgggtcgggggtgggcatcagcagtgagcagccgctcaggacgagcaggccaccggcaagcagcagcgtacgcatagaagactccgaagctcctttaacccggccgccatccgtcgcgccttggaaaaacgccttgcgttcctccgcctcgccggatcgcggaccggtgctggtagggcggcgggcggtccgcgtgctgtgctatgttccgcccatgccacgccgccttcgccatccgcttgctgaccttcgactgccccgttgggttccctgcctggcgctgttggcgctgagcggttgctcgaccgtctcctactacgggcaactggccagcggccagttcgccctgctgcgcgcccgcgagccggccgccgcggtgatcgccgacccgcagcgcgacgcgcgcttgcgcgaacgcctggcgaaggcggaaaaggcccggcaattcgccagcgaacgcctcggcctgccggacaaccgcagctatcgcctgtacgccgatatcggccggccctacgtggtatggaacgtgttcgccaccccggagctgtcgctgcagccggtcacccattgcttccccatcgccggctgcgtggcctaccgcggctactacagcgaggccgccgcgcgcgccgaggcggcgcgccagcgggcgctcggcgacgacgtctacgtcggcggggtgcaggcctactcgaccctcggctggttcgacgatccgatcctcagcagcatgctgcgctgggacgacgaacggctggcgaccttgatcttccacgaactggcgcaccagaagttctacctgcgcgacgacaccgccttcaacgaatccttcgccaccttcgtcgaacaggaaggtacccgccagtggcgcgagtatcgtggactgccgccggcggacggccgcgaggagaagcgccgcgagcagttcaccgcgctggtcctggccagtcgtgcgcgcctcgaagcactttatgccgggccgttggacgatgccgccaagcgtgccggcaaggctgccgaattccagcgcctgcgccgcgagtacgcggcgctgagccagcgcgaatggggtggcgagtcgccgttcaaggcctggatcgacgcgccgttcaacaatgccaagctgcttcccttcggcctctacgaccaatgggtggcggcgttcgccgtgctgttccgccaggtcggcggcaactggccggcgttctatgcgcgggtccgtgcccttggccagctccccctggcggagcgccaggcggcgttgcagcggctggccgccgcagcgccctgacgcctgctcaggcggcgagctggtcggcgtagcaccagcgcgtggccagccggccgatcggccagagcagcgccaacaggccgacgccgagcagcgccaccagcagcgtatagccgatgccagcgggcgccaggccgaggatcatcagcagcgccagccccccgccgaccgccagcagcgcgacgctccagagcagcatggcgaccaccgcgagcagcagcgcgcggccggcggcgaagcgttgcaggcgcgccggcaggcgcgtgcagacggcgccgaagagcagcgccgcgggcaacgccacgccgctcaggtacaggccgtatagccaaggctcgtcgtagcgcagcagggcgtagggaaggaactgcatcagcttgaaacacagcgtggcgaaacacagcgcggcgcccagggcgacctgccaggcagcgacgcgggcttcttccccttcggccaggcgcggcgagttcacccggctgccgagcagcaccagccccaacggcagcaggctgcccaggagcaggtagacccagctcatcgcttcgttgaacgccatcagccagacgccgtagctggattgcgccgtcacccactggtagaacggcagcgtcagcggtgccaggccgatcccggcgagcatgccgcagaccaggttgagcagaccgtagccgatcagcagcagcgccagcgggcggaactcgacgagctgccgcttctcgcggtaggcatgcagcaccagcaggttggccgccgcgtagaacaccaggccggtgaaccagtgcggcgccatcagttgcaggtgctcggagaaacgctggcggatctcgccaatgtcgttgtaccactggatgcccaggcttacggcgaaggacaggcaggtgaccagcgccagcaccgcgatgaacgcatagggctgggtggtggcgggcacctctctggccggcggctgcaccggggcggtgggggtggcgaaggggttgtcggtcatgtcaggcgtccttgtctgaaacggagcatgggtcagtgggattccaatacctgccgcagggcggcgaggtcggcgcagtaatgggtcggctggtgcgcgcgcagttcgtcttcgctgccgaagccgtagccgacgccgatgcaggcgacaccgttgcggctggcgccgagcaggtcgtgcatgcggtcgccgatcatcaggcaatgctccgctgccaggccttcgctgtcgagcagatggcggatcagttcctccttgtgcgtgcgcgtgccgtccagctcgctgccgtagatcgccttgaagtgacggtcgaaggcgaagtggcgggcgatctcgcgggcgaacacgccgggcttgctggtcgcgacgtagagcgtgtggccgcgtccgaccagggcttcgagcagctcgggaatgccgtcgaacacgcggttctcgtagagaccggtgaccctgaagcgctcgcggtagtggttcaccgcctcccaggcgcgcgcttcgtcgaagccgtaggtctgcatgaagcactgcaacagcggggggccgatgaagtgttccaggcgcgccaggtccggctcgtcgatgcccaggcgggcgagggcgaactgcaccgagcgggtgatgccctcgcgtgggtcggtgagggtgccgtcgagatcgaagaggatgttcgggtagcgcagcgcggcgtcacgcatggtagtcctcggcgatgtgcaggtccttgagcttcacgtagttgccggcggtgtaggcgaagaagccgcgctccttgtcgctcagcggacgggccttcttcgccgggctgccgacgtagaggaagccgctctccagcaccttgcccggcggcaccaggctgccggcgccgaggatcacttcgtcctcgatcaccgcgccgtccatgacgatcgagcccatccccaccagcacccggttgccgatgctgcaaccgtgcagcaggaccttgtgcccgacggtcacttcgtcgccgatgctcagcggaaaaccgtccgggttgaaggggccggcgtgggtgatgtgcagcacgctgccgtcctggatgctgctgcgctggccgatgcggatgcggtgcatgtcgccgcggatcaccaccagcggccagaccgagctgtcggcgccgatctcgatgtcgccgacgagcacggccgagggatcgacgaagacccgctcgccgagcagtggcgttttgccctggtaggaacgaatggtcacgatagttttcctcaggctgcggatgccgccgattgtatttaagatggtcgggtatttccttagccaaggttgccaacgtgagcgcgaatccccttctgcaggcctacgacctgccgcctttctcctccattcgcccggaacacgtgaagccggccatcgagcggatcctcgccgataaccgcgccgccatcgcccgcctgctggaaacccagcgcgagcagccgacctggaagggcctggtgctggcgatggacgaactcaacgaccgtctgggcgccgcctggagtccggtcagccacctcaacgcggtgtgcaaca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igem2sbol 1 iGEM to SBOL conversion Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1 James Alastair McLaughlin Chris J. Myers 2017-03-06T15:00:00.000Z