BBa_K563057 1 BBa_K563057 yeast vector with CIT2-Tor 2011-10-13T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:42Z From BBa_K563003 and BBa_K563011 Yeast vector contains CIT2-Tor. When TORC1 is inactive, the mutated tor will be expressed and increase the activity of TORC1. This device helps yeast resist amino starvation and inhibitors. The plasmid contains LEU2, pBS ori, KanR, CEN/ARS，mutated TOR. false false _731_ 0 7195 9 Not in stock true Promoter CIT2 promotes the expression of Tor, using XhoI ligate these two parts. false Boxuan Zeng component2158189 1 BBa_K563011 component2158187 1 BBa_K563003 annotation2158187 1 BBa_K563003 range2158187 1 1 490 annotation2158189 1 BBa_K563011 range2158189 1 499 8616 BBa_K563003 1 BBa_K563003 promoter of CIT2 2011-10-04T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:42Z Amplified from genome of S.cerevisiae CIT2 encodes Citrate synthase. Its promoter is controlled by rtg1 transcription factor. When TORC1 is inactive, Rtg1 tranlocates into the nuclear and promoter the expression of CIT2.In our project, we will promoter our mut-Tor2 by the promoter of CIT2 and construct the feed back loop. false false _731_ 0 7195 9 It's complicated false NcoI and XhoI are at the ends of the promoter false Boxuan Zeng annotation2155647 1 promoter of CIT2 range2155647 1 1 489 BBa_K563011 1 BBa_K563011 Tor2 with L1415P mutation 2011-10-04T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:42Z From the parts BBa_K563010, mutated by circular PCR. The Tor2 with L1415P mutation will be insensitive to amino starvation and inhibitor. Its activity is more stable than tor2 without mutation. false false _731_ 0 7195 9 It's complicated false According to the mutation Tor in mammalian cell, we found the mutation of Tor2 in S. cerevisiae. When we mutated BBa_K563010, we found that it is necessary to use more efficient DNA polymerase, to ensure the quality of the PCR product. DpnI is necessary to deal with the PCR product to degrade the plasmid which is not mutated. Anyone can take this part by cutting the plasmid with NcoI and PstI. false Boxuan Zeng annotation2153080 1 L1415P mutation range2153080 1 4825 4827 BBa_K563057_sequence 1 ccacaacataagccgctttggagtgttgaacaaatccgtccttgggtcattcaatcaatggcttggcggtatctcaaaagagcgcaaactaatagcgcgcacattcgacgcatttatccggtggtcatcgactaggggcgaagaggtcacgacctattttttcttgcagaaaaaaagtgtgaccttttccgtagctagacgtctatcagggcgtcagcaatgggaggcacagcggaaaaacaataacaatggtaagcgcaattaccttttgagcgttacattcgtatgaaattggtgacgttaatctaaagatagtcatgctctcaaaagggcccattattctcgacgttgagcgtatataagactattaaaacttggttctttagatatggtgttcgttcctcattattaagtttcagggaacaatatcaacacatatcataacaggttctcaaaactttttgttttaataatactagtaacaagaaaatactagagcacagcaattaaaagtcggagaacctgactgaaaattcatgaatctcttcatttctatagcctttcctctatgcatttgtattatatatttattaccgtcattttttacatactgctgcattttggcgccagtgataagtggcaaacaattcgacggaatcgtggtaattataccacgttactctataacatcatgatattgcaattaatcaaacatacatttaatcttaatgctattagcttactacaactcttttctttaagttatatcgtatatttcttgggcgatgtcagaatatttacccggatattcctttttaagcactgaatatgtttgaatagagactgacatatatggcagcaattaaaattggaagaaatgtaatgacagtaggaaagaccaatttttatcatcgtgacaccaatcacttccttaactgagctttacttgtatttatttacaggtagattaggagcagtagaaagggaaaatataccgggtgcataaagagcatagtcattaagatcaaatagttatctttctcaaagagatttctgatctttactttccccatatgaaaaatgaataaatacattaacaaatacaccacgccacctaacttattgtctttacgacaaagggccgaaggcaaacacagaacaagaaagaaacttacacacaaatcgcactcccacgatgatgagatgtcaactacttcaaacacagattccaatcacaatgggcccaatgactctggtagagtgatcactggttctgctggtcatattggtaaaatatcctttgtagattcagaactagatacaacattttctactttaaatttgatttttgataaacttaaaagcgatgtgccacaagaacgagcctctggcgctaatgaattaagcactactttgacctcattagcaagggaagtatctgctgagcaatttcaaaggtttagcaacagtttaaacaataagatatttgaacttattcacgggtttacttcaagtgagaagataggtggtattcttgctgttgatactctgatctcattctacctgagtacagaggagctgccaaaccaaacttcaagactggcgaactatttacgtgttttaattccatccagtgacattgaagttatgagattagcggctaacaccttaggtagattgaccgtgccaggtggtacattaacatcagatttcgtcgaatttgaggtcagaacttgcattgattggcttactctgacagcagataataactcatcgagctctaagttggaatacaggagacatgctgcgctattaatcataaaggcattagcagacaattcaccctatcttttatacccttacgttaactctatcttagacaatatttgggtgccattaagggatgcaaagttaattatacgattagatgccgcagtggcattgggtaaatgtcttactattattcaggatagagaccctgctttgggaaaacagtggtttcaaagattatttcaaggttgtacacatggcttaagtctcaatacgaatgattcagtgcatgctactctgttggtatttcgagaattactcagcttgaaagcaccttatctcagggataaatatgatgatatttacaaatctactatgaagtacaaggaatataaatttgatgttataaggagagaagtttatgctattttacctcttttagctgcttttgaccctgccattttcacaaagaaatatctcgataggataatggttcattatttaagatatttgaagaacatcgatatgaatgctgcaaataattcggataaaccttttatattagtttctataggtgatattgcatttgaagttggttcgagcatttcaccctatatgacacttattctggataatattagggaaggcttaagaacgaaattcaaagttagaaaacaattcgagaaggatttattttattgcattggtaaattagcttgtgctttgggcccagcttttgctaagcacttgaacaaagatcttcttaatttgatgttaaactgtccaatgtccgaccatatgcaggagactttaatgatccttaacgagaaaataccctctttggaatctaccgttaattcgaggatactaaatttactgtcgatatccttatctggtgaaaaatttattcaatcaaaccaatacgattttaataatcaattttccattgaaaaggctcgtaaatcaagaaaccaaagtttcatgaaaaaaactggtgaatctaatgacgatattacagatgcccaaattttgattcagtgttttaaaatgctgcaactaattcatcatcaatattccttgacggagtttgttaggcttataaccatttcttacattgagcatgaggattcgtctgtcagaaaattggcagcattaacgtcgtgtgatttatttatcaaagacgatatatgtaaacaaacatcagttcatgctttacactcggtttctgaagtgctaagtaagctattaatgatcgcaataactgatccggttgcagaaattagattggaaattcttcagcatttggggtcaaattttgatcctcaattggcccaaccagacaatttacgcctacttttcatggcgctgaacgatgagatttttggtattcaattggaagctatcaaaataataggcagattgagttctgtcaaccccgcttatgtagttccttctttgaggaaaactttactggaactattaacgcaattgaagttctcaaatatgccaaaaaaaaaggaggaaagtgcaactctattatgtacgctgataaattccagcgatgaagtagcgaaaccttatattgatcctattctagacgtcattcttcctaaatgccaggatgcttcatctgccgtagcatccaccgctttaaaggttttgggtgaactatctgttgttggaggaaaagaaatgacgcgttacttaaaggaattgatgccattgatcattaacacatttcaggaccaatcaaactcttttaaaagagatgccgccttaacaacattaggacagctggctgcttcctctggttatgttgttggccctttactagactacccagagttacttggcattttgataaatattcttaagactgaaaacaaccctcatatcaggcgtggaactgttcgtttgattggtatattaggcgctcttgatccatataagcacagagaaatagaagtcacatcaaactcaaagagttcagtagagcaaaatgctccttcaatcgacatcgcattgctaatgcaaggggtatctccatccaacgatgaatattaccccactgtagttatccacaatctgatgaagatattgaatgatccatcgttgtcaatccatcacacggctgctattcaagctattatgcatatttttcaaaaccttggtttacgatgtgtctcctttttggatcaaattattccaggtatcattttagtcatgcgttcatgcccgccgtcccaacttgacttttattttcagcaactgggatctctcatctcaattgtcaagcaacatattaggccccatgtcgagaaaatttatggtgtgatcagggagtttttcccgatcattaaactacaaatcacaattatttctgtcatagaatcgatatctaaggctctggaaggtgagtttaaaagatttgttcccgagactctaacctttttccttgatattcttgagaacgaccagtctaataaaaggatcgttccgattcgtatattaaaatctttggttacttttgggccgaatctagaagactattcccatttgattatgcctatcgttgttagaatgactgagtattctgctggaagtctaaagaaaatctccattataactttgggtagattagcaaagaatatcaacctctctgaaatgtcatcaagaattgttcaggcgttggtaagaattttgaataatggggatagagaactaacaaaagcaaccatgaatacgctaagtttgctccttttacaactaggtaccgactttgtggtctttgtgccagtgattaacaaggcgttattgaggaataggattcagcattcagtgtacgatcaactggttaataaattactgaacaatgaatgcttgccaacaaatatcatatttgacaaggagaacgaagtacctgaaaggaaaaattatgaagacgaaatgcaagtaacgaaattaccggtaaaccaaaatatcctaaagaatgcatggtattgttctcaacagaagaccaaagaagattggcaagaatggataagaaggctatctattcagcttctaaaggaatcaccttcagcttgtctacgatcctgttcgagtttagtcagcgtttattatccgttggcgagagaattgtttaatgcttcattctcaagttgctgggttgagcttcaaacgtcataccaagaggatttgattcaagcattatgcaaggctttatcatcctctgaaaacccacccgagatttatcaaatgttgttaaatttagtggaatttatggagcacgatgacaaaccattgcctatcccaatccatacattaggtaagtatgcccaaaaatgtcatgcttttgcgaaggcactacattacaaagaggtagaattcttagaagagccgaaaaattcaacaatcgaggcattgattagcattaataatcaacttcaccaaactgattctgctattggtattttgaagcatgcgcaacaacacaatgaattgcagctgaaggaaacttggtatgaaaaacttcaacgttgggaggatgctccagcagcatataatgagaaggaggcagcaggagaagattcggttgaagtgatgatgggaaaattaagatcgttatatgcccttggagagtgggaagagctttctaaattggcatctgaaaagtggggcacggcaaaacccgaagtgaagaaggcaatggcgcctttggctgccggcgctgcctggggtttggagcaatgggatgaaatagcccagtatactagcgtcatgaaatcgcagtctccagataaagaattctatgatgcaattttatgtttgcataggaataattttaagaaggcggaagttcacatctttaatgcaagggatcttctagttactgaattgtcagctcttgttaatgaaagctacaatagagcatataatgttgttgttagagcgcagattatagcagagttggaggaaatcatcaaatataagaagttgccacaaaattcagataaacgtctaactatgagagaaacttggaataccagattactgggctgtcaaaaaaatattgatgtgtggcaaagaattctgcgtgtcagatcattggtgataaagccaaaggaggatgctcaagtgaggattaagtttgccaacttatgcagaaaatcgggtaggatggcgctagctaaaaaagtcttaaatacattgcttgaagaaacagatgacccagatcatcctaatactgctaaggcatcccctccagttgtttatgcacaactgaagtacttgtgggctacggggttgcaagatgaggctttgaagcaattaattaatttcacatctagaatggctcatgatttaggtttggatccaaataatatgatagctcaaagcgttcctcaacaaagcaaaagagtccctcgtcacgttgaagattatactaagcttttagctcgttgtttcttgaagcaaggagaatggagagtttgcttacagcctaaatggagattgagcaatccagattcgatcctaggctcctatttgctcgctacacattttgacaacacatggtacaaagcgtggcataactgggcactggccaattttgaagtcatttctatgctaacatctgtctctaaaaagaaacaggaaggaagtgatgcttcctcggtaactgatattaatgagtttgataatggcatgatcggcgtcaatacatttgatgctaaggaagttcattactcttctaatttaatacacaggcacgtaattccagcaattaagggtttttttcattccatttctttatcagaatcaagctctcttcaagatgcattaaggttattaactttatggtttacttttggtggtattccagaagcaacccaagctatgcacgagggtttcaacctaatccaaataggcacatggttagaagtgttgccacagttaatttctagaattcatcaacccaatcaaattgttagtaggtcattactctccctattatctgatctaggtaaggctcatccgcaggcattagtgtaccccttaatggttgcgattaaatccgaatctctctcacgacagaaagcagctttgtccatcatagaaaagatgagaatacatagtccagttttggtcgaccaggctgaacttgtcagccacgaattgatacgtatggcggtgctttggcatgagcaatggtatgagggtctggatgacgccagtaggcagttttttggagaacataataccgaaaaaatgtttgctgctttagagcctctgtacgaaatgctgaagagaggaccggaaactttgagggaaatatcgttccaaaattcttttggtagggacttgaatgacgcttacgaatggctgatgaattacaaaaaatctaaagatgttagtaatttaaaccaagcgtgggacatttactataatgttttcaggaaaattggtaaacagttgccacaattacaaactcttgaactacaacatgtgtcgccaaaactactatctgcgcatgatttggaattggctgtccccgggacccgtgcaagtggtggaaaaccaattgttaaaatatctaaattcgagccagtattttcagtaatctcatccaaacaaagaccgagaaagttttgtatcaagggtagtgatggtaaagattataagtatgtgttgaaaggacatgaagacattagacaggatagcttggtcatgcaattattcggactagttaacacgcttttgcaaaatgacgctgagtgctttagaaggcatctagatatccagcaatatccagcaatcccattatctccgaagtctgggttactgggttgggtaccgaatagtgacacgttccatgtattaattagggagcatagagaagccaaaaaaattcctttaaacattgagcattgggtcatgttacaaatggcacctgattatgacaatttaacgttgttgcagaaagtagaagtcttcacttacgccctaaataatacggagggacaagatctttataaggtgttatggctgaagagtaggtcatcggaaacgtggttggagcgtagaactacttacactcgatcgctagccgtgatgtccatgaccggttatatattggggttaggtgaccgccaccctagtaatttgatgttggatagaatcactgggaaagtcattcatattgattttggtgattgtttcgaggctgctatattaagagaaaaattccccgaaaaagtaccttttagattaactagaatgttaacatatgcaatggaagtgagtggaattgaaggtagcttccgtattacttgtgagaatgttatgaaggtacttagagataacaagggttcattaatggcaatccttgaagcttttgctttcgatcctttgatcaattggggttttgacttaccaacaaagaaaattgaggaagaaacgggcattcaacttcccgtgatgaatgccaatgagctattgagtaatggggctattaccgaagaagaagttcaaagggtggaaaacgagcacaagaatgccattcgaaatgcaagggccatgttggtattgaagcgcattactgacaaattaacggggaacgatataagaaggtttaatgacttggacgttccagaacaagtggataaactaatccaacaagccacatcagtggaaaacctatgccaacattatatcggttggtgtccattctggtagttttaatgtattgaaaatcacttagttgtatatagcctgtaaaagtgttgtataaaaatgcatctcattcattaatgtttagttccgagcgtgacgttactaactgcgaaa BBa_K563011_sequence 1 cacagcaattaaaagtcggagaacctgactgaaaattcatgaatctcttcatttctatagcctttcctctatgcatttgtattatatatttattaccgtcattttttacatactgctgcattttggcgccagtgataagtggcaaacaattcgacggaatcgtggtaattataccacgttactctataacatcatgatattgcaattaatcaaacatacatttaatcttaatgctattagcttactacaactcttttctttaagttatatcgtatatttcttgggcgatgtcagaatatttacccggatattcctttttaagcactgaatatgtttgaatagagactgacatatatggcagcaattaaaattggaagaaatgtaatgacagtaggaaagaccaatttttatcatcgtgacaccaatcacttccttaactgagctttacttgtatttatttacaggtagattaggagcagtagaaagggaaaatataccgggtgcataaagagcatagtcattaagatcaaatagttatctttctcaaagagatttctgatctttactttccccatatgaaaaatgaataaatacattaacaaatacaccacgccacctaacttattgtctttacgacaaagggccgaaggcaaacacagaacaagaaagaaacttacacacaaatcgcactcccacgatgatgagatgtcaactacttcaaacacagattccaatcacaatgggcccaatgactctggtagagtgatcactggttctgctggtcatattggtaaaatatcctttgtagattcagaactagatacaacattttctactttaaatttgatttttgataaacttaaaagcgatgtgccacaagaacgagcctctggcgctaatgaattaagcactactttgacctcattagcaagggaagtatctgctgagcaatttcaaaggtttagcaacagtttaaacaataagatatttgaacttattcacgggtttacttcaagtgagaagataggtggtattcttgctgttgatactctgatctcattctacctgagtacagaggagctgccaaaccaaacttcaagactggcgaactatttacgtgttttaattccatccagtgacattgaagttatgagattagcggctaacaccttaggtagattgaccgtgccaggtggtacattaacatcagatttcgtcgaatttgaggtcagaacttgcattgattggcttactctgacagcagataataactcatcgagctctaagttggaatacaggagacatgctgcgctattaatcataaaggcattagcagacaattcaccctatcttttatacccttacgttaactctatcttagacaatatttgggtgccattaagggatgcaaagttaattatacgattagatgccgcagtggcattgggtaaatgtcttactattattcaggatagagaccctgctttgggaaaacagtggtttcaaagattatttcaaggttgtacacatggcttaagtctcaatacgaatgattcagtgcatgctactctgttggtatttcgagaattactcagcttgaaagcaccttatctcagggataaatatgatgatatttacaaatctactatgaagtacaaggaatataaatttgatgttataaggagagaagtttatgctattttacctcttttagctgcttttgaccctgccattttcacaaagaaatatctcgataggataatggttcattatttaagatatttgaagaacatcgatatgaatgctgcaaataattcggataaaccttttatattagtttctataggtgatattgcatttgaagttggttcgagcatttcaccctatatgacacttattctggataatattagggaaggcttaagaacgaaattcaaagttagaaaacaattcgagaaggatttattttattgcattggtaaattagcttgtgctttgggcccagcttttgctaagcacttgaacaaagatcttcttaatttgatgttaaactgtccaatgtccgaccatatgcaggagactttaatgatccttaacgagaaaataccctctttggaatctaccgttaattcgaggatactaaatttactgtcgatatccttatctggtgaaaaatttattcaatcaaaccaatacgattttaataatcaattttccattgaaaaggctcgtaaatcaagaaaccaaagtttcatgaaaaaaactggtgaatctaatgacgatattacagatgcccaaattttgattcagtgttttaaaatgctgcaactaattcatcatcaatattccttgacggagtttgttaggcttataaccatttcttacattgagcatgaggattcgtctgtcagaaaattggcagcattaacgtcgtgtgatttatttatcaaagacgatatatgtaaacaaacatcagttcatgctttacactcggtttctgaagtgctaagtaagctattaatgatcgcaataactgatccggttgcagaaattagattggaaattcttcagcatttggggtcaaattttgatcctcaattggcccaaccagacaatttacgcctacttttcatggcgctgaacgatgagatttttggtattcaattggaagctatcaaaataataggcagattgagttctgtcaaccccgcttatgtagttccttctttgaggaaaactttactggaactattaacgcaattgaagttctcaaatatgccaaaaaaaaaggaggaaagtgcaactctattatgtacgctgataaattccagcgatgaagtagcgaaaccttatattgatcctattctagacgtcattcttcctaaatgccaggatgcttcatctgccgtagcatccaccgctttaaaggttttgggtgaactatctgttgttggaggaaaagaaatgacgcgttacttaaaggaattgatgccattgatcattaacacatttcaggaccaatcaaactcttttaaaagagatgccgccttaacaacattaggacagctggctgcttcctctggttatgttgttggccctttactagactacccagagttacttggcattttgataaatattcttaagactgaaaacaaccctcatatcaggcgtggaactgttcgtttgattggtatattaggcgctcttgatccatataagcacagagaaatagaagtcacatcaaactcaaagagttcagtagagcaaaatgctccttcaatcgacatcgcattgctaatgcaaggggtatctccatccaacgatgaatattaccccactgtagttatccacaatctgatgaagatattgaatgatccatcgttgtcaatccatcacacggctgctattcaagctattatgcatatttttcaaaaccttggtttacgatgtgtctcctttttggatcaaattattccaggtatcattttagtcatgcgttcatgcccgccgtcccaacttgacttttattttcagcaactgggatctctcatctcaattgtcaagcaacatattaggccccatgtcgagaaaatttatggtgtgatcagggagtttttcccgatcattaaactacaaatcacaattatttctgtcatagaatcgatatctaaggctctggaaggtgagtttaaaagatttgttcccgagactctaacctttttccttgatattcttgagaacgaccagtctaataaaaggatcgttccgattcgtatattaaaatctttggttacttttgggccgaatctagaagactattcccatttgattatgcctatcgttgttagaatgactgagtattctgctggaagtctaaagaaaatctccattataactttgggtagattagcaaagaatatcaacctctctgaaatgtcatcaagaattgttcaggcgttggtaagaattttgaataatggggatagagaactaacaaaagcaaccatgaatacgctaagtttgctccttttacaactaggtaccgactttgtggtctttgtgccagtgattaacaaggcgttattgaggaataggattcagcattcagtgtacgatcaactggttaataaattactgaacaatgaatgcttgccaacaaatatcatatttgacaaggagaacgaagtacctgaaaggaaaaattatgaagacgaaatgcaagtaacgaaattaccggtaaaccaaaatatcctaaagaatgcatggtattgttctcaacagaagaccaaagaagattggcaagaatggataagaaggctatctattcagcttctaaaggaatcaccttcagcttgtctacgatcctgttcgagtttagtcagcgtttattatccgttggcgagagaattgtttaatgcttcattctcaagttgctgggttgagcttcaaacgtcataccaagaggatttgattcaagcattatgcaaggctttatcatcctctgaaaacccacccgagatttatcaaatgttgttaaatttagtggaatttatggagcacgatgacaaaccattgcctatcccaatccatacattaggtaagtatgcccaaaaatgtcatgcttttgcgaaggcactacattacaaagaggtagaattcttagaagagccgaaaaattcaacaatcgaggcattgattagcattaataatcaacttcaccaaactgattctgctattggtattttgaagcatgcgcaacaacacaatgaattgcagctgaaggaaacttggtatgaaaaacttcaacgttgggaggatgctccagcagcatataatgagaaggaggcagcaggagaagattcggttgaagtgatgatgggaaaattaagatcgttatatgcccttggagagtgggaagagctttctaaattggcatctgaaaagtggggcacggcaaaacccgaagtgaagaaggcaatggcgcctttggctgccgg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BBa_K563003_sequence 1 ccacaacataagccgctttggagtgttgaacaaatccgtccttgggtcattcaatcaatggcttggcggtatctcaaaagagcgcaaactaatagcgcgcacattcgacgcatttatccggtggtcatcgactaggggcgaagaggtcacgacctattttttcttgcagaaaaaaagtgtgaccttttccgtagctagacgtctatcagggcgtcagcaatgggaggcacagcggaaaaacaataacaatggtaagcgcaattaccttttgagcgttacattcgtatgaaattggtgacgttaatctaaagatagtcatgctctcaaaagggcccattattctcgacgttgagcgtatataagactattaaaacttggttctttagatatggtgttcgttcctcattattaagtttcagggaacaatatcaacacatatcataacaggttctcaaaactttttgttttaataatactagtaacaagaaaa igem2sbol 1 iGEM to SBOL conversion Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1 Chris J. Myers James Alastair McLaughlin 2017-03-06T15:00:00.000Z