BBa_K565002 1 BBa_K565002 Colicin H gene cluster 2011-09-16T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:42Z The sequence of the colicin G determinants have been deposited under the accession numbers AJ515251, in the EMBL/GenBank database. A good reference paper on this part is: Patzer et al. Microbiology (2003), 149, 2557???2570 This part was central in our 2011 iGEM project: http://2011.igem.org/Team:Valencia Colicin H protein is produced by Escherichia coli CA 58 strain. Its specific activity making holes in bacterial membranes need the presence of Fiu protein in the outer membrane of target cells in order to recognize them, and use the TonB/ExbB, D translocation route to slip in the cell and lyse it, being lethal for related strains of E. coli. To disinfect the contaminated water in our project, we used Colicin H to kill pathogen cells (in our case they were E. coli DH5alpha strain) by membrane lysis. false false _733_ 0 9951 9 It's complicated true Please see Patzer et al. Microbiology (2003), 149, 2557???2570 for info on this point false Juan Ricardo Ortiz Meneses BBa_K565002_sequence 1 agtcagacattctcagtcaggctgcaggttatagctattcctgactgattcgtcattttattcttattgattataactggcattacactggtgccggagtgtttttctgtaagtctgcgccggttcagtaaattagaaaagaaacatttgtcagcgccagtgatataaggtgtaacggctaacaatcttggcgttgatacattccgagcaaataaccgaagtgttacttttagtgacggggttatccaatacttttctagtcagtgtttagtatttatgcaagcgatgtaagtagtaaccgcttagactattgacattcatgatgcctgttaattcaaatttcaggtatgatctgtcatttattgttgtgatactgattctgctaggttggcataactgtcctgcaaatcattgtttaaaaaagaaagctcctacaaactgtatcctgtatctctaccagaagataagatactttgttatttttgtgcataagctcacataaaaataatattaattatgttttcttagcgatagaaaaataaacaggtaagcagaagacggacttttttaatgcgaaaacgtattctttttattggccctccgctgtacggtttgttatacccattgatttctctggctcaggcctttcgtgtaatcggacatgatgtagtaattagtagcgctggcaaattcgcgaataaagcagcagaagctggactggttgtttttgatgcagctccaagtttagattcagaggctggatatcgccatcaggaagagttgaggaaaaaaagtaatattattggtcatttctctttttttagcgatgaaatggcagataacctcatcgattttgcaggaaaatggaggccagatttaatagtctatcccccgcttggtccggcaggcccattggttgctgctaaatatagaattccttcagtgatgctggctgttggattcgcgcatacatctgcccatattcagatgttaaaccgttctttaagcaatgcttacaggcggcatggagtcagcggtccactatgtgatttagcatggattgatgttgctcccccaagtatgagcattcttaaaaatgctgaagaaccggttatctcaatgagatatattccttataacggaggtgctgtaaaggaaacatggtgggacagggattccgatcggaaacgtttactcatcagccttggcactgtaaaaccaatggttgatggtctggagctgatttcatgggttatggattctgcaaatgaagttgatgctgatatcattttgcaacttgcaataaatgctcgtactggattacgaaaactaccatcaaatgtacgtctggttgactggatacctatgggtgtattccttaatggagctgatggatttattcatcacggtggcgcaggtaataccctgacagcgctgtatagtggaataccacagattgtgtttggcgaaggtgcagatcgctctgttaatgcagaaattgttgcgaagcgtgggtgtgggattattccggacaagcatggactgaccagtgatttggtaaatcgcctgctttatgatgattcactacgcttctgttcagatcaggtagccgctgaaatggctgaacaacccagtcctgcagagatcgcagaggttttgatgagaaaattaaaaaacaacgggaaataattgtagcgtattgctgaaattttcaacgagaaatgttatgagtaatataatgtccttcatcacataaatgaaggacattactaaataaatgagacagtctcccataataatattgcagaaagagttatcggacgataaaacgatattttacacagagttattatttgataccatcctgcaattataatttgctaattcatcaataattgctccgcgccaccaagcataatcgtgaccaccggtatagacagtgaggttactttccaaaccagctgcgattaacgaatgatgcaatcgctgaacatgtgagacggttgtaccttctaaagaaccgactccaagtcggatatttacatctttcggaggcgctgaaagtatctgctcacttacccaggaggtatcattctcagtaaacaaaatcgggctgccctggtcagggttccaccacattgaaggtgagtgactaatgattgtaccaaatgttgtcgacgcatatatagctgccatcagtgctgtcactccaccgaggctctgcccggccagtacagtattagagcgaccagcccatacgatatccggatagtctctgtataactggggtatcagattttccgctatatcaaagatgagttctttattgcctcccagtatattcatacgatcagattcattaatattgtctatccccataattgccattggcgtgatacgaccagtggtgatggccatatctaatgcccgggtaatatctatccggtcaaaccatgtttcagcatcaggtaacacaagtaatccaagaggtactgatgttggattcaggggaaaatataaacgaatccggcgttgatatcctgcaacaaaggaatgtaatgttgaaagaatacctgtacatttatgggaagtatcatcccattccttttgttcaggagccatatcaagagaaaggactgattctccgaatcctcgtatatttatttctgctgttttgttaaatggatcagatttaccgggtaatggagagaagcgacttcctagttgaaatatgtctttttgtgtcatatctgtgggaatttctataaatgagtatgagccccgatatgaagctggtaacaccagtgtcagcatccagatatctgtcgaagggatatgagtcattagtccttttttgacgtcttttttatctgtaacacgattcaggcgaagatatacgccttgcagtgctttctctgagcgccacagaaatgtaacctcccgattttctgtagtggtgctttttgtgatcactggaagtgttgctgactcaagatagtgccagaaattagcaatatctgttgttcttattgtgacaggatgtgtcattttttttaactgtacacaaatatcttcgggagtctggaaaagatagtttttcataggtatcatcttaaattaatccaagtgtaagaataatacatcaaatgacgttcattcaagggatgatgagtgactttcctgaattaaatctgttgtattgatgataaatataaaacaggtttaataaaatttttgctttatactgtagatttcacgtatgtaagtaatatatgaaaaggctctcgttaagatgtctggtacaaaatgacagatcatatgcctttgtaaagagacgacagaagtagagtcttacaggcacatcataaatcagcatggccggagggtatttatttaactgccgctgtttgcactggatgtggaactactcatactataagaaggtccacttaccccccggatacatgatgatggatggagtacccggagcccagcatgctccattagcatcaatatatgttcccatatcttttcctcgtagatctattacattagtagaaccgggtaatccattaagattcatccctcctttcacgaaatcaagcatgtgatctgatatttctctcattttaaaaacctcctactcatttatgttcatagactggccccctgaatctccagacaaccagtatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactctggtcgccgccggagaacaggttgttcctgcctctgaacttctgccgccatgaagcagattaaagaactccagcgcctgctcggcaagaaaacgatggaaaatgaactcctcaaagaagccgttgaatatggacgggcaaaaaagtggatagcgcacgcgcccttattgcccggggatggggagtaagcttagtcagccgttgtctccgggtgtcgcgtgcgcagttgcacgtcattctcagacgaaccgatgactggatggatggccgccgcagtcgtcacactgatgatacggatgtgcttctccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggtatgggcgctgcttcgcagacaggcagaacttgatggtatgcctgcgatcaatgccaaacgtgtttaccggatcatgcgccagaatgcgctgttgcttgagcgaaaacctgctgtaccgccatcgaaacgggcacatacaggcagagtggctgtgaaagaaagtaatcagcgatggtgctctgacgggttcgagttccgctgtgataacggagaaaaactgcgagtcacgttcgcgctggactgctgtgaccgtgaggcactgcactgggcggtcactacgggcggcttcaacagtgaaacagtacaggacgtaatgctgggagcggtggaacgccgcttcggcaacgagcttccggcgtctccagtagagtggctgacggataatggttcatgctaccgggctaatgaaacacggcagtttgcccggatgttggggcttgaaccgaagagcacggcggtgcggagtccggagagtaacggcatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtgtcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatgcgatccgcatagtgcactgggttatcgctcgccacgggaatatctacggcagcaagccagtaatgggttaagtgataacaggtgtctggaaatataggggcaaatccagttcagatattaatttggtgttgcaaccatttattatcacagaattcagaatatcattcagttttatttttgttaaaatatcccctcttaagacagacacatattcttgtttatcattttcagtaaacaatgactctatattttctacgtttaaataatatagcccacaagcagcataaattttagactccttagttgacattctattttttattatatttttaaatatctcttcgggattatctaatgtaagaatgtgtgtgtataatttttccccttcgctctgatagcctataaacccattcatacctatagaaaaataggttgttttttctaacgattgttgaaggggaggtggatctgatgaaaatgcagcagatggtaatataaacatcatacttattataatctttttcgtaagatacatactttcccctttggttttccatcgataaatgttcagataaacaatatatgttttttcttgttaatgtttatatcgatggttttataacatggaatattcagcataataatcaacaggcttgtacctgatcaggtatcagtttgcaaaaatgtttgttataggtcatgaccgcaaccaggacacataatttcaccacaaccacaaatataatcggcatcatagtcatgtgttactataccggaagccgacttattatttgtgatacagtgtgtctcctgctctacggaggattctacctctataggaaaattatcgtgttttcgtcttgaattgtcttgcttgttgcctttatcaaaggtaacaatgaattcttcatttctgtgattattatcacaattcattcttatgcctcctcacatttcccgatgtatgaccgtcagtgctattagtgtacgttcaagtctcaggttatacatgagcgacaaccatgagatcctgactaacaattgcatcagttacataacgtaaaatacctcttgactttatatggacaatatgacactttttttgaaaagtaaataacaatcattctcttttgtctttgtctgggtgaggtcaggtaagatggaatttgctacaaacagggttactgtaaatgacagtcggtcagcactgtcatcaactttgctgttgtctttgatcatgagcgccactctactggaatattctttatcgatgacctgacttccctgactgaagcgctaagatttggtaacttttcataatgaaaataaagcaacaggtaggtattaatgagttataaaaaactgtaccaattgacggctatattcagtttacctcttactatcttattggtttcactttcatcccttcggattgttggcgaagggaattcttatgttgacgtttttctaagctttataatatttcttggttttattgagctgattcatgggattcgaaagattctggtctggtcaggctggaaaaacggaagttaaatatgatggagtttatatgcgagaaataacagaatcacagttaagatatatttccggggcgggaggtgcgccagcgacttcagctaatgctgcaggtgctgcagctattgttggagctctcgccggaatacctggtggtccacttggggttgtagttggagccgtatctgccggtttgacaacagcaattggctcgaccgtgggaagtggtagtgccagttcttctgctggtggcggtagctaattataattttatttattttacgggcactttttcggtagtgcctgtaaaatatatccctttcgtttaaagcagatagaagatccatttataagtgtgtttttatgttcaacactttactgatgaagatatgatttacagtcgttgataaataatttttaatttatgtgtaattaatagagttattactgtaataaggaagaagctgtcagaacacttacttgctcttttatgaacactcttttatgaaaattaaaacggagaatactgccagatgagtcatcagtgttcactttctgaactgaatgaaaacctggtgcctttcactgccaggcagatcaagtcctcattaatctggtgtgcagaggatgtcagaaatccaggcgagctgcaaaatgcctgcagttatattatcgatcctgacagtacggcttctgccaaagtgttccatgcagagcgctatggtggcagtggtattcagcgtaatggaggtggtgcacgttgtgggtttgatggtaactaccaggttaaaggaataggaagtaatccgttggttggcgaaggtactgacgaacgtcattctaatggtgcactcggcgctgttcatgcaatatatgaggctttgtggggagaagtactggctcaaatattaccttatagtgctgtgcgggttcgggcggttttacttacagatctctatactgaaaaggcatttgagcgctccggtaggaaatcacgaagagccctgttggtacgtgagcctgttgttcgcccggcgcattttgaacgggcaccttactttcaagtaaaaccggagtattccagtctattaattcacgatgcctgtcgggttagatctgtgatccacaagctgccaggatatctacctgtaccaccggaagaaattgatgctgaagcacgaactgatccccggatttattgcattgaggggttatgtgaactggcacgtcgtgaggcctggcaaatggcattttgtcgaacacgtttcctgagattgacaacttctccttctaatattgcaatggatggcagattaatggattttaacggactcagttgtctgtttccgggagattccccagctgattttgggtataaactaagattagctgaactggcaaaagaaccgatggtacttatgcaagggctgtctgatctctgcttgtatatcggaaaatatatgtttgaccctgacttcactcttgcagcccgtttgaaggttgaggagatatttcagaaaacttttcatgaagcatgttattactgttatctagaactgttgggtattcctggagaatttataacacaaaaagagatacctgatatattgaaagaactggttaacagttttgttgcattactcaataaatactgtgagaaatcacatgcccaagatattgtcaatcaggatggttcaccattgcaaaagttggttgtgacgctaatccatcataggcataatcaaaagcaggcactgaatagtagcatcaagaatgatgtttatttcacagttgcacaacagtgtttttcccaggccatccactggctgacgcaaggcagtaccagacgtcagataaatgcctcattactcctgaaagaaattgaacatcataccatgaaaaggctgcaacccagggaagagctgaggaaagagaatatgtgcgaaaaaattgccatcctgctggataatcatggcgatgatcccctttttttacaagaagaaatttctgatatgaaaaattttatgcttaagttttccagagatgcatttggatatcttgaaccgataagaaacacagtgtaataaatatataaagggaaatagtaatcatgtattatataagggaaaccatcagaggaaaagatgaatggactgtttatgaacagatcggttttgcggtcagttgtatgctctacaatcgtaattacagtctgtatccggtgttaaccattcaatactggactgaatatgcgatacagcataatcagattaaattcctgtttgattcacgaggttttccactggcgtatattacctgggcatatcttgaggctgatacagaagcgcgcctgctcagggatccagaattcaggttgcatccgtctgaatggaatgaagatggaaggatctggattctggatttctgttgtaaaccaggctttggtcgaaaagttattgactatctcatacagcttcagccatggggagaaggagaagtacgatggttaagcaggcgaaagaaaattgtgacatacatccctgagcggctgcataaaacgtagtacctctgaagatacagagataattgtaaattacggggtaaatgcatcgctgatactattttgacaggactctgtattttctggctttgattatagcatttcggttaaccagtgaaggtattacaggaaaagtgtgagtaagaggagctattttgtttcgtcaggatgctttagaaaacagaaaaatgaagtggcagggacgggcaatattacttcccggaataccactatggttaatcatgctgggaagcatagtgtttattacggcatttctgatgttcatcattgttggtacctatagccgccgtgttaatgtcagtggtgaggtcacaacctggccaagagctgtcaatatatattcaggtgtacagagatttgttgtcaggcagtttgttcatgaaggacagttgataaaaaaaggggagcctgtttatctgattgacatcagtaaaagtacacgtagtggtattgtcactgataatcatcgtcgggatatagaaaaccagctggttcgtgtggacaagattatttcccgtctggaagaaagtaaaaaaataacgctggataccctggaaaaacaacgtctgcaatacacagatgcgtttcgtcgctcatcagatattatacagcgtgcagaggaagggataaaaataatgaaaaacaatatggagaattacagaaactatcaggcaaaagggctgattaataaagatcagttaactaaccaggtggcattatattatcagcaacaaaacaatcttctcagcctgagcggacagaacgaacagaatgccctgcagataaccactctggagagtcagattcagactcaggctgcagattttgataaccgtatctaccagatggaactgcaacggtacgagttacagaaagaactggttaacactgatgtggagggcgaaatcattatccgggcgttgactgacgggaaagttgactccctgagtgtcactgtcgggcaaatggtcaataccggagacagccttctgcaggttattccagagaacattgaaaactattatcttattctctgggtcccgaatgatgctgttccttatatttcggctggtgacaaagtgaatattcgttatgaagcctttccggcagaaaaatttgggcagttctctgctacggttaaaactatatccaggactcctgcgtcaacacaggaaatgttgacctataagggagcaccacagaatacgccgggcgcctctgttccctggtataaagtcattgcgatgcctgaaaagcagattatcagatatgacgaaaaatacctccctctggaaaatggaatgaaagccgaaagtacactatttctggaaaaaaggcgtatttaccagtggatgctttctcctttctatgacatgaaacacagtgcaacaggaccgctcaatgactaacgggaatttcagacaaattataaatcagcttgatatgcgctggcgacgtcgtgttccggttattcatcagacggagaccgctgaatgtggactggcctgcctggcaatgatatgcggtcattttggtaagaatattgacctgatatctcttcgccggaagtttaatctctcggcccgtggagcaaaccttgcaggaatcaatggaatagcggagcagctggggatggtcacccgggctctttcactggagctggatgaacttggtgccctcaaaatgccgtgtattctccactgggatttcagtcacttcgtcgtgctggtcagcgtaaagcgtaaccgttatgtactgcatgatccggccagaggcagaagatatctcggtcgggaggaaatgagccggtattttacgggcattgcacttgaggtctggcccggaagtgaattccaggtggaaacccagcagacccgcataagtctccgttcactgattaacagtatttacggtattaaaagaacactggcgaaaattttctgtctgtcagttgtaattgaagcaatcaatctggtaatgccggtgggaactcagctggttatggatcatgcgattccggcgggggacagagggctgctgacgcttatttctgctggcctgatgttctttatattgctcagggccgcggtgagtatgctgcgtgcatggtcctcactggttatgagcacgctcatcaatatacagtggcagtcgggtctgtttaaccatcttctcagactgccgctggcgttttttgaacgccgtaaattaggtgatatccagtcgcgttttggctcccttgacactttgagggccacctttaccacctgtgtggttggggcaatcatggacagtattatggttgtaggtgtttttgtgatgatgctgttatatggaggatatcttacttggatagttctcggttttaccatggtttacgttcttattcgtctggtgacatacggctattaccggcaaatatcggaagaaactcttgtcaggggggcccgggccagctcctattttatggaaagcctgtatggtattgccacggtaaaaatccagggtatggtcgggatccggggaacacactggcttaacctgaaaatagatgcgatcaattcaggtattaagttaactaggatggatttgctcttcgggggaataaatacttttgttgccgcctgtgatcaggtggcgattttatggctgggtgcaagccttgtgatcgataatcagatgacaatagggatgtttgtggcatttggttcttttcgtgggcagttttcggatcgggttgcttcgctgaccagttttcttcttcaactgagaataatgagtctacataatgagcgcattgcagatattgcactacatgaaaaggaagaaaagaaaccggaaattgaaatcgttgctgacatgagcccggtttcactggaaaccactgatttaagctaccggtatgacagccagtcagcacaggtattcagtggtctgaatttgtctgtggctccgggagaaagtgtggctataactggtgcctccggtgccggaaaaaccacattaatgaaagtattatgtggactgtttgaaccagatagtggaaaagtactggttaatggcacggatatacgtcaatttggaataaataattatcaccgtatgatagcctgtgttatgcaggacgaccggctattttcaggatcaattcgtgaaaatatctgtgggtttgcagaagaaacagacgacgaatggatgacagaatgtgccagagcaagtcatattcatgatgtgataatgaaaatgccaatggggtatgaaacgttaataggtgaactgggggaaggtctttccggcggtcaaaaacagcgtatattcattgcccgagctttataccggaaacctggaatattatttatggatgaggctacaagttctcttgatacagaaagtgaacgtttcgtgaatgctgccataaaaaaaatgaatatcacccgggtgattattgcacacagagaaactacgttgagaactgttgacaggattatttctatttaaaatccactggtgtaactttgtaaggagttttgtcgatgggggaggttaagaaggatataaaaataacagtgattgcttttgttatcaattatctgttcttttatattccggtgtcattatatcttagttattactatggatataatttttttaatctatatatgttttttttatcacttgtagttacatttttatcgttgtggttaaacgtgaatttttacttcttcacaaatcttatagcgaaggtgttgaaatgagaaaactatctgaaaatgaaataaaacaaatatctggaggtgacgggaatgacgggcaggcagaattaattgctattggttcacttgctggtacgtttattagcccgggatttggttctattgcaggggcttatataggtgataaagtacattcatgggcaacgactgcgacggttagtccctccatgtctccctcaggtataggattatcatcccagtttggatccggcagaggtacatcaagtgcctcttcgtctgcggggagtggaagttaaaccttatattgttaatgaagcacatgttacaggtgcttcattatatgataatggtgcctatgtaacgctttaagttaggctcctccgaacgtttattattttatgcataccgcatagtaacaatgccagtccgtttaatttttatcatatgagattgtaacagaaaatactctgttaatgagtataactgatagaagccagatattgtattcctgctatgactgcattcatcgacatgtgaagtaatatgggcattaacaggccattcgactttatttttgcactaataagaactaacgataccagaaagagcatcaaaaatgtacgaaagtcagtatattgttgatgtaatgcagaaaatatgactgatgttacaatagcagaggtgtaaatattgtcattaaaccagaatttaaaagagttaaaaagacaccctcgaaatacaatctcttcatatacaggaacaagaagcacagaagaaaatatattaatccataaaatggccccggaaaaagacatttgcgagatcatccattcttccgttttcctcactgccagcagataagggacaaataactgaataatcattattaaagagaaaagagtaaaaaaaacatccagtcgaaaagaacctcttcctaatccttctctttttcggaagaaaataaaatacagtggaacaagaattagaaattcagcaagaaataatgctggaacaagaagccccctggatataagttcctgcctgtttgtaagaaatgcaggaataaaggtaatagaaaatgataaagtaaacattgaaaagcagccgactgatgactgtttttttatagttgcatttttattttttgttatttccatttaaattcccttacttgtcgtttaaaattcttttatataacaggaagaggtaaccatagaatgaacgtttattttcctgtatcagaatagccataacttttatttta igem2sbol 1 iGEM to SBOL conversion Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1 Chris J. Myers James Alastair McLaughlin 2017-03-06T15:00:00.000Z