BBa_K590003 1 mamKL mamKL, from <i>Magnetospirillum magneticum</i> 2011-09-14T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:47Z Extracted from host genome Magnetospirillum magneticum strain AMB-1 AMB#0965,0966; Gene function: mamK is required for proper magnetosome chain organization; it is bacterial actin-like cytoskeleton protein required for proper alignment of the magnetosomes in a chain, shown to localize the mamI; mamL is crucial to mangneosome membrane creation, shown to be spread across the cell membrane and sometimes forms lines. false false _761_ 0 10712 9 In stock false sequence confirmed false Michael Brasino, Alicia Wong, Rashmi Ravichandran annotation2138181 1 mamK range2138181 1 48 1091 annotation2138182 1 mamL range2138182 1 1147 1383 BBa_K590002 1 mamJ mamJ, from <i>Magnetospirillum magneticum</i> 2011-09-14T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:47Z Extracted from host genome Magnetospirillum magneticum strain AMB-1 AMB#0964; Gene function: proper magnetosome chain organization/assembly false false _761_ 0 10712 9 In stock false sequence confirmed false Michael Brasino, Alicia Wong, Rashmi Ravichandran annotation2138180 1 mamJ range2138180 1 70 1590 BBa_K590000 1 mamHI mamHI, from <i>Magnetospirillum magneticum</i> 2011-09-14T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:47Z Extracted from host genome Magnetospirillum magneticum strain AMB-1 AMB# 0961,0962; Gene function: Loss of mamI causes no membrane formation, found localization onto chains false false _761_ 0 10712 9 It's complicated false sequence confirmed false Michael Brasino, Alicia Wong, Rashmi Ravichandran annotation2138081 1 mamH range2138081 1 85 1380 annotation2138082 1 mamI range2138082 1 1417 1626 annotation2138176 1 mamAB Promoter range2138176 1 25 71 BBa_K590001 1 mamE mamE, from <i>Magnetospirillum magneticum</i> 2011-09-14T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:47Z Extracted from host genome Magnetospirillum magneticum strain AMB-1 AMB#0963; Gene function: membrane-bound serine protease required for magnetite formation; might control the localization of other magnetosome proteins false false _761_ 0 10712 9 In stock false sequence confirmed false Michael Brasino, Alicia Wong, Rashmi Ravichandran annotation2138177 1 mamE range2138177 1 29 2215 BBa_K590017 1 mamHIEJKL mamHIEJKL in vector pGA3K3 2011-09-14T11:00:00Z 2015-05-08T01:12:47Z Made from Gibson reaction First part of full assembly false false _761_ 0 10712 9 It's complicated false Partial sequence confirmed, microscopy shows cells chain formation with this plasmid false Michael Brasino, Alicia Wong, Rashmi Ravichandran component2220751 1 BBa_K590002 component2220754 1 BBa_K590003 component2220749 1 BBa_K590001 component2220747 1 BBa_K590000 annotation2220747 1 BBa_K590000 range2220747 1 1 4291 annotation2220754 1 BBa_K590003 range2220754 1 8171 9609 annotation2220749 1 BBa_K590001 range2220749 1 4292 6544 annotation2220751 1 BBa_K590002 range2220751 1 6545 8170 BBa_K590000_sequence 1 ggtaccttcgtatgaaccctgtgtttatgtgttgtcaaccgcccccgactcgctgttatagtctgaccgaatcggaggtgacgggtgtctcgagtggaagcggctgcggcagaagttaaagtgcgccagcacaacgccctttatttgctgtcggcgttgtgcatggttttcatgaccctggtggttgctattcagccgctattcttgcgaaacgttcttaatatctcattcgaaaccgccggcgccgtcaatgccaatgtgcaggtggtgaccgaggttctggatctcttcatcttcgcctatctcggctacctgtcggatcggatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagactcggatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagacatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttg BBa_K590001_sequence 1 ccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagacggcgggcgcggcgatgcttcctgcggcaaggatctgaagcgctatctgatgctcatgggcgtggttgccctggtcgtcctatttggcgccttcatttaccggcagtcctcgggcggtcttcgtctcggcgccatgttggagcagatggggcggggcaccggccctgccgtcaatgttccggtacagcagggcgggccgtcggcagccgtcaatccggccatgtcggttccggctggtgcccgcgtggcgccgccctcggccgccggtgctatagcgaccatgcctcccatggtggatttcggaccggctcccattggggccggggggccgttctccagcgtcgtcaccttgctgcgcaacagcgtcgtcgccgtgaccgcgtcatcggccaacgggcaggccatgcccgatcccctgggcttggccaaccctgacggactgccccatttcgccaatcccgccacccggtcggtggaaaacatcggcaccggcgtgatcgtccgtaacgacggcttcatcgtcaccaactatcatgtggtgcgcggcgccaattcggtgttcgttaccgtgcaggacgacgtgggctcgacccgctattccgccgaaatcatcaagatggacgaggctctggatctcgccttgctgaaggtcgcccccaagacgccgttgacagccgccgttctgggcgacagcgacggggtgcaggtcgccgacgaagtgatcgccatcgggactcccttcggtctggacatgaccgtcagccgcggcatcatttccgccaagcgcaagtccatggtgatcgagggcgtgacccattccaacctgctgcagaccgacgccgccatcaaccagggcaattccggcggtccgctggtgatttccaacgggacggtggtcggcatcaataccgccatctacacccccaacggcgcctttgccggaataggcttcgccgtgcccagcaatcaggcccgcctgttcatcttggatgaagtgggctggctgccgacctccaccgccgagggggcctccatgggcctggtggccatgcagcgccccatgggcggcggcgtgggcgcggcgggtccggccattttcgccgggactagggcgccccacaccgatggccgccagaacatggattgcaccacctgccacgatctgattccggccggaaacgggcggcccgcgccgatgatgcccatcgccgccccgattccgccgccgccgattcccatgggcgccgtctcgccccataccgacggccgtcagaacatgaactgcgccaattgccatcagatgctgggcggtgccgcgcccatcgccgcaccgggactcggcgggggggcttaccgcttcgcgcagccgccgggaagcctggccatcaatattcaggggccgcgcggcgggcagtcgaccgccgccggaaccggccgggtcacgcttttgggcgccgccttgactcccatgtcgcagcgccttggcgcccagaccggcgtaccggtcggacgcggagtgttcatctccggcgtcacgcccaatactccggcggcgacggcggggctgcggcccggcgacgtcttgctcaaggtggacggccgtcctgtccgcctgccggaagaagtctccgccatcatggtcgagatgcatgccggacggtcggtgcggctcggcgtcctgcgcgatggcgatgtgcgcaacatgaccctggtcgcgggacccgccggtctggccgccgcagcggtccaggctccggccattgccgacatggcgcagccgcccatgggcggcatggcccccactgcacccggcatggtcgcggttcccggtggtccggccgtcatgccgaagcctccgaccgagttcaactggctgggcatggagatcgaaaccttccaggcgccgcgtccgatcaccggtgtgccgggcgccgttccggttcccggagccaagggtgcccaggtggccgaggttctggtcgggtcccgggccgccgtggcggggctccaggccaatgacctcatcctcgaggtcaataatcggccggtggccggtccggctcgtctcgacgccgccattaagggggcgacgaatgccgggcagcagattttgctgaaggtcaaccgcaatggccaagagttctggattgtcctttgatggtggagctggataatggcgaataaccggcgagatcg BBa_K590017_sequence 1 ggtaccttcgtatgaaccctgtgtttatgtgttgtcaaccgcccccgactcgctgttatagtctgaccgaatcggaggtgacgggtgtctcgagtggaagcggctgcggcagaagttaaagtgcgccagcacaacgccctttatttgctgtcggcgttgtgcatggttttcatgaccctggtggttgctattcagccgctattcttgcgaaacgttcttaatatctcattcgaaaccgccggcgccgtcaatgccaatgtgcaggtggtgaccgaggttctggatctcttcatcttcgcctatctcggctacctgtcggatcggatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagactcggatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagacatcgggcgggtcaggatcatcgtggccggttttctggtcgccgccatcggtgcggtgatcgcgccgctcagcccctggatcggcggtgcctccatcggggcgctggtcgtctattacgtttcgcgggtcatcatgtcggcgggcagcggcgcggtatggcctcaattgtcggccctggccggggatttcagcgacgacgacacccgggcgcgcctgatgtccaataccgcgttcatgatggccttcggggtgacgctggtctacgctgttttgatgcagatcccggcccatgcgggcatcgccgtgaccatgctgctgacggcggcggtctccctggccggtgcttggctggcggggaaattcctggtggatgtcgctccgcgcacccaggaaacctcggttccctggcgggcggtctggagcttggtgaaggcggagccccgcctgcgcctggctttcgccagttcgctgttcgcccgcagcgacatggtgttcgtagggctcttcctcatgctgtggttcatctactttgccgatctgatcaaggtcgggcaggccgaggcggcggcgcgggccggaatcttgatcgggctgatgggggcggtggtcatgctctcgatcccggtttggcggtcgtttatcgagcatttcggccgcattcaggcggttctgctcgggatggtgctctccgccctgggattcataatgttgggtttcatcatcaatccgttcgactggttcatcgtactgcccatcttgttgattgcgtccgggcaggctggttgttttgtggcgcctcaaatattaacagttgactacgcgcctagggatttgcttgggtctgtgcttggcgcatttaatgttattgggtgcattggtattattttctttgttcaggtcggcgggtttttatttgattatgttggcccgccggcaccttttgtctttactggtgttggaaacttgattatatcggcgtatgcattgcgcctgctaaaacgcgaggcgcgtgacggcggcggcgacgacgccccaggggacgacggggtggcgtagcgccattcgctctgcatcaagactggagtaacgtttatgccaagcgtgattttcggactgctggcgcttgccctcggattgctgggggtgacggcatggtggtggtcggtgaccgagttcctgcgcggagcggtgccggtggccctgctcatccttggcttggtcgcgttggcctccggggtgcaatccgtgcggttgcctcgttccaacaaggggaccgcttcagaccctgacatcgatggttgccgcttcagaccctgacatcgatggttgatggccatgttcaatggtgacgtagaagacggcgggcgcggcgatgcttcctgcggcaaggatctgaagcgctatctgatgctcatgggcgtggttgccctggtcgtcctatttggcgccttcatttaccggcagtcctcgggcggtcttcgtctcggcgccatgttggagcagatggggcggggcaccggccctgccgtcaatgttccggtacagcagggcgggccgtcggcagccgtcaatccggccatgtcggttccggctggtgcccgcgtggcgccgccctcggccgccggtgctatagcgaccatgcctcccatggtggatttcggaccggctcccattggggccggggggccgttctccagcgtcgtcaccttgctgcgcaacagcgtcgtcgccgtgaccgcgtcatcggccaacgggcaggccatgcccgatcccctgggcttggccaaccctgacggactgccccatttcgccaatcccgccacccggtcggtggaaaacatcggcaccggcgtgatcgtccgtaacgacggcttcatcgtcaccaactatcatgtggtgcgcggcgccaattcggtgttcgttaccgtgcaggacgacgtgggctcgacccgctattccgccgaaatcatcaagatggacgaggctctggatctcgccttgctgaaggtc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igem2sbol 1 iGEM to SBOL conversion Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1 James Alastair McLaughlin Chris J. Myers 2017-03-06T15:00:00.000Z