BBa_B0010
1
BBa_B0010
T1 from E. coli rrnB
2003-11-19T12:00:00Z
2015-08-31T04:07:20Z
Transcriptional terminator consisting of a 64 bp stem-loop.
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Randy Rettberg
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BBa_B0010
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BBa_K769103
1
BBa_K769103
lux CABFEG
2012-09-18T11:00:00Z
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Photobacterium kishitanii strain NCMB 844 lux-rib operon
lux CABFEG
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lux CABFEG
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Mayumi Nakamura
BBa_B0012
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BBa_B0012
TE from coliphageT7
2003-01-31T12:00:00Z
2015-08-31T04:07:20Z
Derived from the TE terminator of T7 bacteriophage between Genes 1.3 and 1.4 <genbank>V01146</genbank>.
Released HQ 2013
Transcription terminator for the <i>E.coli</i> RNA polymerase.
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<P> <P>Suggested by Sri Kosuri and Drew Endy as a high efficiency terminator. The 5' end cutoff was placed immediately after the TAA stop codon and the 3' end cutoff was placed just prior to the RBS of Gene 1.4 (before AAGGAG).<P> Use anywhere transcription should be stopped when the gene of interest is upstream of this terminator.
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Reshma Shetty
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polya
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BBa_B0012
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T7 TE
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34
BBa_B0034
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BBa_B0034
RBS (Elowitz 1999) -- defines RBS efficiency
2003-01-31T12:00:00Z
2015-08-31T04:07:20Z
Released HQ 2013
RBS based on Elowitz repressilator.
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Varies from -6 to +1 region from original sequence to accomodate BioBricks suffix. <p>No secondary structures are formed in the given RBS region. Users should check for secondary structures induced in the RBS by upstream and downstream elements in the +50 to -50 region, as such structures will greatly affect the strength of the RBS.
Contact info for this part: <a href="mailto:(bchow@media.mit.edu)">Brian Chow</a>
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Vinay S Mahajan, Voichita D. Marinescu, Brian Chow, Alexander D Wissner-Gross and Peter Carr IAP, 2003.
annotation23325
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conserved
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8
BBa_B0015
1
BBa_B0015
double terminator (B0010-B0012)
2003-07-16T11:00:00Z
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Released HQ 2013
Double terminator consisting of BBa_B0010 and BBa_B0012
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Reshma Shetty
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BBa_B0010
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BBa_B0010
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BBa_K769016
1
BBa_K769016
Promoter(high)-RBS-lux CABFEG-DT
2012-09-18T11:00:00Z
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Photobacterium kishitanii strain NCMB 844 lux-rib operon
Promoter(high)-RBS-lux CABFEG-DT
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Promoter(high)-RBS-lux CABFEG-DT
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Mayumi Nakamura
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BBa_B0034
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BBa_B0034
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BBa_K769103
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BBa_B0015
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BBa_J23100
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BBa_J23100
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BBa_J23100
constitutive promoter family member
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Isolated from library of promoters
Released HQ 2013
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John Anderson
BBa_J23100_sequence
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tattaaaagtttaaaagaaatctataataaaggaaaaggtatttgtttaattggccctccgtatttcatttatttgctatgccagtacatgaaagagaatgatattgaatttaatgcaggtaatcgcatctttattattactggcggtggttggaaaactaagcaaaaacaagcactaaatcgtcaagattttaatcaactattgatggaaaccttccatttagcacatgaaagtcagattcgagatacatttaatcaagttgaattaaatacgtgtttctttgaagataaccgtcagcgtaagcatgttccgccatgggtttatgcacgtgcacttgatcctgtaactctaaagcctgttgaagatggtcaagaagggcttattagttacatggatgcatcatcaacgagttatccaacatttatcgttactgacgatatcggtataattcatacaattaaagatccagatccgtaccaaggcactacgattgatattgtccgtcgtttgaatacgagagagcagaaagggtgttcattatcaatggcatcaggcttgaaatagcttacaaggaagatgtatgattttaaattgtaaaataattaaaattgaagcttctgaatgtaatatttttaaagtatttattaagcctgataagtgtctcaattttaaagctggtcaatatgttttagcatatttagatggtaaaaaattacctttctcaattgctaattgtccgacatgtaatgagcttatagagttacatgttgggagttcggtaaaagaaaccgcagttaaatctatttctcattttttagatgcttttgtgaatagctctgaaatacaaatagatgcacctcatggtaatgcttggctacgtgaagatagtaattctccattattacttatagctggaggtactgggttatcatatatcaatagtattcttagtaattgtgtaaataggaatttgccccgttctatttatgtttactggggagttaataatattgatttattatatgcagacactcaattaaaagctctttctagcgattttaacaatgttaaatacgtacctgttttggaaaactttgacaataattggtacggaaaaaaaggcaatgttattgatgcaataatagaggactttggtgatttatcagaatttgatatctatgtttgcggccctcaaggtatgacacgtagtgttcgtgaaaagttaacatcacttaaaaaagctgatactgataaaatgtttgccgatgcttttgcatatatgtgatactagagccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctctactagagtcacactggctcaccttcgggtgggcctttctgcgtttata
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atgataaagaaaatcccaatgattattggtggcggagagagggatacttcagaacatgaatatcgtgaactcacactaaatagctataaagttagtatacctatcattaatcaagatgatgttgaggcgattaaatcacaaaatgtggaaaataatctaaatatcaatcagatagtgaatttcttatacactgttggtcagaaatggaaaagtgagaattattctcgtcgactaacctatattcgtgatttggtaagatttctcggatattctcctgaaatggcaaaactagaagctaactggatctcaatgatattgagctcaaaaagtgccttatatgatattgttgaaacagagttaggttctcgtcatattgtagatgaatggttacctcagggtgattgttatgtcaaggccatgccaaaaggaaaatctgttcatttgctagccggtaatgtgcctctatctggtgttacttctattattagagcaattctgactaaaaatgaatgtatcattaaaacatcatcagctgatccatttacggcaatagcattagcttcaagttttattgatacagatgaacaccatccaattagccgttcaatgtcggtaatgtattggtctcataacgaagatattgcaatcccacaacaaattatgaattgtgctgatgttgttgttagttggggtggatatgatgcaattaaatgggcaacagaacatacaccggtaaacgtcgacatattaaaatttgggccgaagaaaagtattgcgattgttgataatcctgtagatattacagcttctgctattggtgtggctcatgatatttgtttttatgatcagcaggcctgtttttcaacccaagatatctattatataggcgataacattgatgcgttttttgatgagcttgtagaacaattaaatctatatatggatatattgccaaaaggcgatcaaacatttgatgaaaaggcatcattttcattaattgaaaaagagtgtcaattcgcaaaatataaagttgagaaaggtgataatcaatcttggttacttgttaaatcaccgctaggatcttttggtaatcaaccattagctcgatctgcatatattcaccatgtctccgatatatcagaaataacgccttatatagaaaatagaattactcaaactgtaacagttactccttgggagtcatcatttaaatatagagatgttctagcctctcatggtgctgagcgtattgttgagtcagggatgaataatattttccgtgttggtggtgcgcatgatggtatgagacctcttcaacgtttagttaaatatatttcacatgaaagaccttatacatatacaaccaaagatgtagccgtaaaaattgaacaaacacgttatctcgaagaagataagtttttagtctttgtaccataattacaactgatacataaaccaacaaaaggaatatattatgaagtttggaaatatttgtttctcatatcagcctccaggtgagtcacataaagaagtcatggatcgctttgttcgtttaggcgttgcatcagaagaactaaattttgatacttactggactctcgagcatcattttactgaatttggactaacaggtaacctgtttgttgcttgtgctaacttacttggtcgaaccaccaaactgaatgttggtactatgggtattgttcttccaacagctcaccctgcacgtcagatggaagatttattacttttagatcaaatgtcaaaaggccgttttaattttggtgttgtgcgtggcttgtaccacaaagatttccgcgtttttggtgtaacgatggaagattctcgtgctatcactgaagattttcacaccatgattatggatggtacaaaaacaggtacacttcatactgatggtaaaaacatcgagttcccagatgtaaacgtttacccagaggcgtatttagagaaaattccaacatgcatgactgctgaatcagcagtaacaacgacttggcttgctgagcgtggcttaccgatggttcttagttggattattacaacgagtgaaaagaaagctcaaatggaactctataatgctgttgctcgagatagcggttacagtgaagagtacattaaaaacgttgatcacagtatgaccctcatctgttctgtagatgaagatggcaaaaaagctgaagatgtgtgccgtgagtttttaggtaattggtatgattcatacgtaaatgcaaccaatatctttagtgaaagtaaccaaactcgtggttatgattatcataaaggtcaatggaaagattttgttcttcaaggacatactaatactaaacgtcgtgttgattatagcaacgatctaaaccctgtaggtacacctgaaaaatgtattgaaattattcagcgtgatattgatgcaacaggtattactaatattacccttggtttcgaagcaaatggctctgaggaagaaatcattgcctctatgaaacgcttcatgacgcaagttgcaccattcttaaaagatccaaaataaataaatcactcagattaactttaataaataatataaggaatataacatgaattttggattattcttcctcaactttcagcctgaaaatacatcgtcagaaacagttttagataatatgatcaatactgtctctttagttgataaagattataaaaactttacaactgctttagtcaacgagcaccatttttctaaaaatggtattgtcggtgctccgatgacagctgcaagcttcctattaggactaactgaacgtttacatattggttctttaaatcaagtaattacaacgcatcatccggttcgtattgcagaagaagcaagtttgcttgatcaaatgtcagacagccgctttattctaggtctaagtgattgtgttaatgattttgagatggatttctttaaacggcaacgtgactcacagcagctacaatttgaagcttgctatgacatcattaatgaagctatcacaactaattactgccaagctaataatgatttttataacttccctcgtatctcaattaatcctcattgcttaagtaaagagaatatgaagcaatatattttggcttctagtgtgagtgttgttgagtgggctgctaaaaaagcgcttccactaacatatcgttggagcgatagccttgaagataaagagattctttataagcgttatttagaagttgcagcaaagcataatattgacgtttctaatgtcgagcatcagttcccgctgcttgtaaatttaaatcatgatcgtgatgttgctcatcaagaagcaacggcctatttagtaagttatattgctgaagtatacccacatctaaatcagcaacaaaaaattgctgaacttattagccaacatgcgattggtactgataatgattactatgaatcaacattaaatgcgttagagcgtacaggttcaaaaaatgtattactttcttttgaatcaatgaagaatcatgatgatgttgtaaaagtgattaatatggttaatgagaagattcaaaagaatttaccaagctcgtaagtgtaaaggaagcggtgttattatgaataaatggaattacggagtcttcttcgttaacttttataataaaggccaacaagagccatcaaaaacgatgaataatgcattagaaacattacgtattattgatgaagatacatctatttatgatgtgattaatattgatgaccactatcttgtaaagaaagacagtgaagataaaaagctagcgtcttttattacactaggagaaaaactatatgtgcttgctaccagtgaaaacacagttgatattgcagcgaaatatgcattaccgttagttttcaaatgggatgatataaatgaggaacgacttaaattgttgagtttttataatgcatccgcaagtaaatataacaagaatatagatttggttcgacaccagcttatgttacatgtcaatgttaatgaggcagaaactgtagcaaaagaagaactcaaattatatattgaaaactatgtagcatgtacacagcctagtaattttaatggctcgattgatagtattattcagagtaacgtgacagggagttataaagactgtttgtcatatgtagcgaatcttgctggtaaatttgataatactgtggacttcttactttgttttgagtcaatgcaagatcaaaataagaaaaaatcagtaatgatagatcttaataatcaagttattaagttccgccaagataataatctaatctaatctacaatcattgcctcttataatggcagtgctaatttaaagttctgccattatatttaattatattttaaataggattaaacatgactattacattagatacttgcgaaaaagatattattgtaagtacagagatcgacgatattatttttacatcatcacctcttgatattacttacgatgaacaagaaagaataaagcataaattaatattagaatcatttcgttaccactataataataatgaagattataagtctttctgtaatactcagggggtagacgaaaatatttcatcacttgatgatatccctgtttttccgacctcaatgtttaagtatgcaaaaatatgtacagcagatgagtctaacattgaaaactggttcacaagtagtggtacgagtggtgtaaaaagtcatattgcccgtgatcgtgtaagtattgaacgtttacttggttctgtaaattatggaatgaaatatcttggttcatttcatgaaaatcagctagaacttgttaatatgggacctgatcgttttaatgctaaaaatgtttggtttaagtatgtaatgagtcttgttgagttattatatccaactacatttactgtaaataacgatgaaatagattttgaacttactattaaaagtttaaaagaaatctataataaaggaaaaggtatttgtttaattggccctccgtatttcatttatttgctatgccagtacatgaaagagaatgatattgaatttaatgcaggtaatcgcatctttattattactggcggtggttggaaaactaagcaaaaacaagcactaaatcgtcaagattttaatcaactattgatggaaaccttccatttagcacatgaaagtcagattcgagatacatttaatcaagttgaattaaatacgtgtttctttgaagataaccgtcagcgtaagcatgttccgccatgggtttatgcacgtgcacttgatcctgtaactctaaagcctgttgaagatggtcaagaagggcttattagttacatggatgcatcatcaacgagttatccaacatttatcgttactgacgatatcggtataattcatacaattaaagatccagatccgtaccaaggcactacgattgatattgtccgtcgtttgaatacgagagagcagaaagggtgttcattatcaatggcatcaggcttgaaatagcttacaaggaagatgtatgattttaaattgtaaaataattaaaattgaagcttctgaatgtaatatttttaaagtatttattaagcctgataagtgtctcaattttaaagctggtcaatatgttttagcatatttagatggtaaaaaattacctttctcaattgctaattgtccgacatgtaatgagcttatagagttacatgttgggagttcggtaaaagaaaccgcagttaaatctatttctcattttttagatgcttttgtgaatagctctgaaatacaaatagatgcacctcatggtaatgcttggctacgtgaagatagtaattctccattattacttatagctggaggtactgggttatcatatatcaatagtattcttagtaattgtgtaaataggaatttgccccgttctatttatgtttactggggagttaataatattgatttattatatgcagacactcaattaaaagctctttctagcgattttaacaatgttaaatacgtacctgttttggaaaactttgacaataattggtacggaaaaaaaggcaatgttattgatgcaataatagaggactttggtgatttatcagaatttgatatctatgtttgcggccctcaaggtatgacacgtagtgttcgtgaaaagttaacatcacttaaaaaagctgatactgataaaatgtttgccgatgcttttgcatatatgtga
BBa_B0012_sequence
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BBa_B0015_sequence
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igem2sbol
1
iGEM to SBOL conversion
Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1
James Alastair McLaughlin
Chris J. Myers
2017-03-06T15:00:00.000Z