BBa_K769022
1
BBa_K769022
lux operon(K769011) + GFP(I13522)
2012-09-18T11:00:00Z
2015-05-08T01:13:14Z
P.kishitanii
Released HQ 2013
lux operon(K769011) + GFP(I13522)
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Tomomi YOKOYAMA
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BBa_K769011
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BBa_I13522
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BBa_I13522
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BBa_K769011
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BBa_K769011
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BBa_K769011
Promoter(Pbad)-RBS-lux operon-DT
2012-09-18T11:00:00Z
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Photobacterium kishitanii strain NCMB 844 lux-rib operon
Promoter(Pbad)-RBS-lux operon-DT
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Mayumi Nakamura
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BBa_K769010
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BBa_B0015
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BBa_B0034
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BBa_I0500
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BBa_B0012
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BBa_B0012
TE from coliphageT7
2003-01-31T12:00:00Z
2015-08-31T04:07:20Z
Derived from the TE terminator of T7 bacteriophage between Genes 1.3 and 1.4 <genbank>V01146</genbank>.
Released HQ 2013
Transcription terminator for the <i>E.coli</i> RNA polymerase.
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<P> <P>Suggested by Sri Kosuri and Drew Endy as a high efficiency terminator. The 5' end cutoff was placed immediately after the TAA stop codon and the 3' end cutoff was placed just prior to the RBS of Gene 1.4 (before AAGGAG).<P> Use anywhere transcription should be stopped when the gene of interest is upstream of this terminator.
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Reshma Shetty
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BBa_B0012
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BBa_B0010
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BBa_B0010
T1 from E. coli rrnB
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Transcriptional terminator consisting of a 64 bp stem-loop.
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Randy Rettberg
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BBa_B0010
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BBa_B0034
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BBa_B0034
RBS (Elowitz 1999) -- defines RBS efficiency
2003-01-31T12:00:00Z
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Released HQ 2013
RBS based on Elowitz repressilator.
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Varies from -6 to +1 region from original sequence to accomodate BioBricks suffix. <p>No secondary structures are formed in the given RBS region. Users should check for secondary structures induced in the RBS by upstream and downstream elements in the +50 to -50 region, as such structures will greatly affect the strength of the RBS.
Contact info for this part: <a href="mailto:(bchow@media.mit.edu)">Brian Chow</a>
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Vinay S Mahajan, Voichita D. Marinescu, Brian Chow, Alexander D Wissner-Gross and Peter Carr IAP, 2003.
annotation23325
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conserved
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8
BBa_I13522
1
BBa_I13522
pTet GFP
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Untagged GFP behind a constitutive promoter.
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jkm
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BBa_B0010
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BBa_R0040
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BBa_B0012
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BBa_B0010
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BBa_E0040
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GFP
green fluorescent protein derived from jellyfish Aequeora victoria wild-type GFP (SwissProt: P42212
2004-09-29T11:00:00Z
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Released HQ 2013
GFP (mut3b) [note that this part does not have a barcode]
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jcbraff
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BBa_B0015
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BBa_B0015
double terminator (B0010-B0012)
2003-07-16T11:00:00Z
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Released HQ 2013
Double terminator consisting of BBa_B0010 and BBa_B0012
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Reshma Shetty
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BBa_B0010
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BBa_B0012
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BBa_B0012
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BBa_B0010
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BBa_I0500
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pBad/araC
Inducible pBad/araC promoter
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-- No description --
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Sri Kosuri
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AraC
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Pbad
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PC
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BBa_R0040
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p(tetR)
TetR repressible promoter
2003-01-31T12:00:00Z
2015-05-08T01:14:14Z
Lutz, R., Bujard, H., <em>Nucleic Acids Research</em> (1997) 25, 1203-1210.
Released HQ 2013
Sequence for pTet inverting regulator driven by the TetR protein.</P>
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<P> <P>BBa_R0040 TetR-Regulated Promoter is based on a cI promoter. It has been modified to include two TetR binding sites and the BioBrick standard assembly head and tail restriction sites.<P>
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June Rhee, Connie Tao, Ty Thomson, Louis Waldman
annotation1986787
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-10
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BBa_R0040
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BBa_K769010
1
BBa_K769010
lux operon
2012-09-18T11:00:00Z
2015-05-08T01:13:14Z
Photobacterium kishitanii strain NCMB 844 lux-rib operon
lux operon
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Mayumi Nakamura
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luxF
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luxB
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4514
BBa_B0010_sequence
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ccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctc
BBa_K769011_sequence
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ttatgacaacttgacggctacatcattcactttttcttcacaaccggcacggaactcgctcgggctggccccggtgcattttttaaatacccgcgagaaatagagttgatcgtcaaaaccaacattgcgaccgacggtggcgataggcatccgggtggtgctcaaaagcagcttcgcctggctgatacgttggtcctcgcgccagcttaagacgctaatccctaactgctggcggaaaagatgtgacagacgcgacggcgacaagcaaacatgctgtgcgacgctggcgatatcaaaattgctgtctgccaggtgatcgctgatgtactgacaagcctcgcgtacccgattatccatcggtggatggagcgactcgttaatcgcttccatgcgccgcagtaacaattgctcaagcagatttatcgccagcagctccgaatagcgcccttccccttgcccggcgttaatgatttgcccaaacaggtcgctgaaatgcggctggtgcgcttcatccgggcgaaagaaccccgtattggcaaatattgacggccagttaagccattcatgccagtaggcgcgcggacgaaagtaaacccactggtgataccattcgcgagcctccggatgacgaccgtagtgatgaatctctcctggcgggaacagcaaaatatcacccggtcggcaaacaaattctcgtccctgatttttcaccaccccctgaccgcgaatggtgagattgagaatataacctttcattcccagcggtcggtcgataaaaaaatcgagataaccgttggcctcaatcggcgttaaacccgccaccagatgggcattaaacgagtatcccggcagcaggggatcattttgcgcttcagccatacttttcatactcccgccattcagagaagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtctataatcacggcagaaaagtccacattgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccatacccgtttttttgggctagctactagagaaagaggagaaatactagatgataaagaaaatcccaatgattattggtggcggagagagggatacttcagaacatgaatatcgtgaactcacactaaatagctataaagttagtatacctatcattaatcaagatgatgttgaggcgattaaatcacaaaatgtggaaaataatctaaatatcaatcagatagtgaatttcttatacactgttggtcagaaatggaaaagtgagaattattctcgtcgactaacctatattcgtgatttggtaagatttctcggatattctcctgaaatggcaaaactagaagctaactggatctcaatgatattgagctcaaaaagtgccttatatgatattgttgaaacagagttaggttctcgtcatattgtagatgaatggttacctcagggtgattgttatgtcaaggccatgccaaaaggaaaatctgttcatttgctagccggtaatgtgcctctatctggtgttacttctattattagagcaattctgactaaaaatgaatgtatcattaaaacatcatcagctgatccatttacggcaatagcattagcttcaagttttattgatacagatgaacaccatccaattagccgttcaatgtcggtaatgtattggtctcataacgaagatattgcaatcccacaacaaattatgaattgtgctgatgttgttgttagttggggtggatatgatgcaattaaatgggcaacagaacatacaccggtaaacgtcgacatattaaaatttgggccgaagaaaagtattgcgattgttgataatcctgtagatattacagcttctgctattggtgtggctcatgatatttgtttttatgatcagcaggcctgtttttcaacccaagatatctattatataggcgataacattgatgcgttttttgatgagcttgtagaacaattaaatctatatatggatatattgccaaaaggcgatcaaacatttgatgaaaaggcatcattttcattaattgaaaaagagtgtcaattcgcaaaatataaagttgagaaaggtgataatcaatcttggttacttgttaaatcaccgctaggatcttttggtaatcaaccattagctcgatctgcatatattcaccatgtctccgatatatcagaaataacgccttatatagaaaatagaattactcaaactgtaacagttactccttgggagtcatcatttaaatatagagatgttctagcctctcatggtgctgagcgtattgttgagtcagggatgaataatattttccgtgttggtggtgcgcatgatggtatgagacctcttcaacgtttagttaaatatatttcacatgaaagaccttatacatatacaaccaaagatgtagccgtaaaaattgaacaaacacgttatctcgaagaagataagtttttagtctttgtaccataaaagggaattaatatgaaaagtgaaaacaattctgtaccaattgatcatgttataaaagttgataacgaacgtcatatacgtgtttgggaaactttccctaaaaatcaatgtgataaaagaaataatactattgttattgcttctggttttgctcgaagaatggatcattttgcaggtttagctgaatatttatcaaccaatggatttcatgttattcgttatgattcacttaatcatgttggattaagtagcggtgaaattgatcagttctcaatgtcagtaggtaagaaaagtttattaaccgttattgactggttgaaatcagagcatggtattgatcaggtaggtttaattgcatcgagtctttctgctcgaattgcttatgatattgtcgctgatgttaatttgtcttttttaattactgccgttggtgtggtcaatttacggaatactcttgaacaagcgcttaaatatgattacttgcagatggagatagatgaaataccagaagatttagatttcgatggatataatttaggttcaaaggtatttgttacagattgttttgaaaataactgggatacattagattcaactataaataaaacgaaaaatttaaatgtcccatttatagcttttgtcgccaatgatgatagttgggtacaacagcacgaagtcgaagaattaatgagtaatatcaattcagataaaaccaagatttactctttaataggttcatcacatgatttaggtgaaaacctaattgtgttaagaaatttctatcaatcaattactaaagcagcaattgcattagatagtaatttagtagggttagtaagtgagattattgaaccacaatttgaagctctcactattgctacagtaaatgaacgtcgtttgaaaaataaaatacaaagtaagtcattagcttaattacaactgatacataaaccaacaaaaggaatatattatgaagtttggaaatatttgtttctcatatcagcctccaggtgagtcacataaagaagtcatggatcgctttgttcgtttaggcgttgcatcagaagaactaaattttgatacttactggactctcgagcatcattttactgaatttggactaacaggtaacctgtttgttgcttgtgctaacttacttggtcgaaccaccaaactgaatgttggtactatgggtattgttcttccaacagctcaccctgcacgtcagatggaagatttattacttttagatcaaatgtcaaaaggccgttttaattttggtgttgtgcgtggcttgtaccacaaagatttccgcgtttttggtgtaacgatggaagattctcgtgctatcactgaagattttcacaccatgattatggatggtacaaaaacaggtacacttcatactgatggtaaaaacatcgagttcccagatgtaaacgtttacccagaggcgtatttagagaaaattccaacatgcatgactgctgaatcagcagtaacaacgacttggcttgctgagcgtggcttaccgatggttcttagttggattattacaacgagtgaaaagaaagctcaaatggaactctataatgctgttgctcgagatagcggttacagtgaagagtacattaaaaacgttgatcacagtatgaccctcatctgttctgtagatgaagatggcaaaaaagctgaagatgtgtgccgtgagtttttaggtaattggtatgattcatacgtaaatgcaaccaatatctttagtgaaagtaaccaaactcgtggttatgattatcataaaggtcaatggaaagattttgttcttcaaggacatactaatactaaacgtcgtgttgattatagcaacgatctaaaccctgtaggtacacctgaaaaatgtattgaaattattcagcgtgatattgatgcaacaggtattactaatattacccttggtttcgaagcaaatggctctgaggaagaaatcattgcctctatgaaacgcttcatgacgcaagttgcaccattcttaaaagatccaaaataaataaatcactcagattaactttaataaataatataaggaatataacatgaattttggattattcttcctcaactttcagcctgaaaatacatcgtcagaaacagttttagataatatgatcaatactgtctctttagttgataaagattataaaaactttacaactgctttagtcaacgagcaccatttttctaaaaatggtattgtcggtgctccgatgacagctgcaagcttcctattaggactaactgaacgtttacatattggttctttaaatcaagtaattacaacgcatcatccggttcgtattgcagaagaagcaagtttgcttgatcaaatgtcagacagccgctttattctaggtctaagtgattgtgttaatgattttgagatggatttctttaaacggcaacgtgactcacagcagctacaatttgaagcttgctatgacatcattaatgaagctatcacaactaattactgccaagctaataatgatttttataacttccctcgtatctcaattaatcctcattgcttaagtaaagagaatatgaagcaatatattttggcttctagtgtgagtgttgttgagtgggctgctaaaaaagcgcttccactaacatatcgttggagcgatagccttgaagataaagagattctttataagcgttatttagaagttgcagcaaagcataatattgacgtttctaatgtcgagcatcagttcccgctgcttgtaaatttaaatcatgatcgtgatgttgctcatcaagaagcaacggcctatttagtaagttatattgctgaagtatacccacatctaaatcagcaacaaaaaattgctgaacttattagccaacatgcgattggtactgataatgattactatgaatcaacattaaatgcgttagagcgtacaggttcaaaaaatgtattactttcttttgaatcaatgaagaatcatgatgatgttgtaaaagtgattaatatggttaatgagaagattcaaaagaatttaccaagctcgtaagtgtaaaggaagcggtgttattatgaataaatggaattacggagtcttcttcgttaacttttataataaaggccaacaagagccatcaaaaacgatgaataatgcattagaaacattacgtattattgatgaagatacatctatttatgatgtgattaatattgatgaccactatcttgtaaagaaagacagtgaagataaaaagctagcgtcttttattacactaggagaaaaactatatgtgcttgctaccagtgaaaacacagttgatattgcagcgaaatatgcattaccgttagttttcaaatgggatgatataaatgaggaacgacttaaattgttgagtttttataatgcatccgcaagtaaatataacaagaatatagatttggttcgacaccagcttatgttacatgtcaatgttaatgaggcagaaactgtagcaaaagaagaactcaaattatatattgaaaactatgtagcatgtacacagcctagtaattttaatggctcgattgatagtattattcagagtaacgtgacagggagttataaagactgtttgtcatatgtagcgaatcttgctggtaaatttgataatactgtggacttcttactttgttttgagtcaatgcaagatcaaaataagaaaaaatcagtaatgatagatcttaataatcaagttattaagttccgccaagataataatctaatctaatctacaatcattgcctcttataatggcagtgctaatttaaagttctgccattatatttaattatattttaaataggattaaacatgactattacattagatacttgcgaaaaagatattattgtaagtacagagatcgacgatattatttttacatcatcacctcttgatattacttacgatgaacaagaaagaataaagcataaattaatattagaatcatttcgttaccactataataataatgaagattataagtctttctgtaatactcagggggtagacgaaaatatttcatcacttgatgatatccctgtttttccgacctcaatgtttaagtatgcaaaaatatgtacagcagatgagtctaacattgaaaactggttcacaagtagtggtacgagtggtgtaaaaagtcatattgcccgtgatcgtgtaagtattgaacgtttacttggttctgtaaattatggaatgaaatatcttggttcatttcatgaaaatcagctagaacttgttaatatgggacctgatcgttttaatgctaaaaatgtttggtttaagtatgtaatgagtcttgttgagttattatatccaactacatttactgtaaataacgatgaaatagattttgaacttactattaaaagtttaaaagaaatctataataaaggaaaaggtatttgtttaattggccctccgtatttcatttatttgctatgccagtacatgaaagagaatgatattgaatttaatgcaggtaatcgcatctttattattactggcggtggttggaaaactaagcaaaaacaagcactaaatcgtcaagattttaatcaactattgatggaaaccttccatttagcacatgaaagtcagattcgagatacatttaatcaagttgaattaaatacgtgtttctttgaagataaccgtcagcgtaagcatgttccgccatgggtttatgcacgtgcacttgatcctgtaactctaaagcctgttgaagatggtcaagaagggcttattagttacatggatgcatcatcaacgagttatccaacatttatcgttactgacgatatcggtataattcatacaattaaagatccagatccgtaccaaggcactacgattgatattgtccgtcgtttgaatacgagagagcagaaagggtgttcattatcaatggcatcaggcttgaaatagcttacaaggaagatgtatgattttaaattgtaaaataattaaaattgaagcttctgaatgtaatatttttaaagtatttattaagcctgataagtgtctcaattttaaagctggtcaatatgttttagcatatttagatggtaaaaaattacctttctcaattgctaattgtccgacatgtaatgagcttatagagttacatgttgggagttcggtaaaagaaaccgcagttaaatctatttctcattttttagatgcttttgtgaatagctctgaaatacaaatagatgcacctcatggtaatgcttggctacgtgaagatagtaattctccattattacttatagctggaggtactgggttatcatatatcaatagtattcttagtaattgtgtaaataggaatttgccccgttctatttatgtttactggggagttaataatattgatttattatatgcagacactcaattaaaagctctttctagcgattttaacaatgttaaatacgtacctgttttggaaaactttgacaataattggtacggaaaaaaaggcaatgttattgatgcaataatagaggactttggtgatttatcagaatttgatatctatgtttgcggccctcaaggtatgacacgtagtgttcgtgaaaagttaacatcacttaaaaaagctgatactgataaaatgtttgccgatgcttttgcatatatgtgatactagagccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctctactagagtcacactggctcaccttcgggtgggcctttctgcgtttata
BBa_B0034_sequence
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tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcac
BBa_E0040_sequence
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igem2sbol
1
iGEM to SBOL conversion
Conversion of the iGEM parts registry to SBOL2.1
Chris J. Myers
James Alastair McLaughlin
2017-03-06T15:00:00.000Z